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teng821225

[交流] 单倍型分析软件

本人最近在试验数据的处理上遇到了很大的困难。可谓一头雾水呀,希望能得到各位大侠的指点。我一个基因有三个位点有SNP,这样以来导师就让我要坐单倍型分析,这下可难倒我了,不知道从何下手,这方面的资料也吧熟悉,看了一下版里已有的资料,发现自己还有几个问题要继续解决,希望得到大家的帮助。
   1.在做单倍型之前有必要先做一下连锁不平衡分析,软件使用哪个?有没有具体的下载网址,刚才试了版里提供的好几个网址,我都无法打开,不知道是为什么,能否再提供一下
    2.单倍型分析软件也是一样,一般使用比较多的是SHEsis软件,PHASE软件,可是这些软件不知道上哪里下载,提供的网址好像都打不开呀,没法下载呀
    3. 能否解释一下上述的软件的使用方法。
谢谢大家了,希望大家能帮助我,我真的希望能得到大家的帮助,伸出你的手来帮助一个处于迷茫中的人吧!谢谢
    如果可以的话把软件直接发到我的邮箱,呵呵,这样比较方便,我邮箱:chen8503@126.com
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fengweixing00

木虫 (小有名气)

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1949stone(金币+1,VIP+0): 11-18 13:40
知道有个很好的软件叫haploview 4.1,楼主可以试一下
2楼2009-11-18 13:26:11
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qqsvery

木虫 (著名写手)

★ ★
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1949stone(金币+1,VIP+0): 11-18 13:40
我们用的是ABI公司的测序仪!把经过前期处理的96孔板DNA样放入就ok了!
谎言和真实在河边洗澡,谎言先洗好,穿走了真实的衣服,真实却不肯穿谎言的衣服。后来人们眼里只有穿着真实衣服的谎言,却很难接受赤裸裸的真实。
3楼2009-11-18 13:33:28
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teng821225

引用回帖:
Originally posted by fengweixing00 at 2009-11-18 13:26:
知道有个很好的软件叫haploview 4.1,楼主可以试一下

谢谢!请问你会使用这个软件吗?
4楼2009-11-19 16:47:21
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yzhang1986

铁杆木虫 (文坛精英)

优秀版主


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学生物的学软件米人教还真是痛苦
5楼2009-11-19 18:38:12
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teng821225

不知道你会不会用这方面的软件呀?如果会的话能不能传授一点呀!谢谢
6楼2009-11-20 20:05:03
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刺客616

金虫 (正式写手)


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楼主,计算单倍型可以用fhase软件或者arlequin软件,一般haploview软件是用来计算连锁不平衡的。你给我一个邮箱我把软件发给你。
刺客——用一生的时间熟悉一只枪。
7楼2009-12-25 21:00:16
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