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dorothy

金虫 (小有名气)

[交流] 如何降低兼并引物的兼并度

举个例子,设计的兼并引物序列中有CAR,在该物种的密码子偏好中查到CAA 14.5  CAG 21.6,那我是不是选择CAG呢,  兼并引物序列中有GCN,在该物种的密码子偏好中查到 GCU 20.6,GCC 30.2, GCA 13.8,GCG 11.0,那我就选择GCC,这样可靠吗
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09021122

木虫 (正式写手)

这个不能就凭借数值的变化来选取碱基。要看引物设计在软件中的稳定性
雄关漫道真如铁,而今迈步从头越
2楼2009-11-17 13:07:03
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dorothy

金虫 (小有名气)

请问楼上的 我是不是可以先这样选择后再在软件里检查稳定性,如果不稳定,在换其次的碱基呢?
3楼2009-11-17 14:18:41
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微毛虫

金虫 (小有名气)

退火温度稍微底点~~~
踮起脚尖才能更接近阳光
4楼2009-11-17 16:45:04
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yzhang1986

铁杆木虫 (文坛精英)

优秀版主

进行同源比对,看看
5楼2009-11-17 18:33:00
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dorothy

金虫 (小有名气)

我设计的兼并引物
5' CAYCCNGGNAARGAYTT 3'
5' GTYTTYTGYTTNARDATRTT 3'
物种 Cordyceps militaris
希望高手能帮我降低兼并度。。。。
6楼2009-11-18 08:08:41
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