24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 502  |  回复: 0

我太秀了

铜虫 (小有名气)

[交流] CRISPR文库数据分析怎么做?iScreenAnlys™一站式平台详解

做 CRISPR 文库筛选实验时,最让人头疼的往往是后续数据分析——涉及样本分组、差异基因筛选、火山图、通路富集等多个维度。传统手动处理不仅耗时费力,还容易出错,没有编程基础更是难以上手。那么,有没有一种无需写代码、即可一站式完成数据处理到结果输出的“傻瓜式”工具?

为了解决这些痛点,源井生物推出了 iScreenAnlys™ 文库分析平台。它相当于你的“专属数据分析助手”,打通从原始数据处理到结果可视化与导出的完整流程,让你在实验结束后快速完成分析工作,大幅提升效率。

一、iScreenAnlys™分析平台三大核心优势

1. 零基础也能产出“期刊级”结果

平台内置 MAGeCK 等主流富集分析流程,可自动完成测序数据质控、差异分析、功能注释与可视化,一步生成符合国际期刊规范的图表报告。无论是没有编程经验的科研新手,还是药企研发人员,都能轻松获得可直接解读的专业结果。

2. 多算法支持,降低分析偏倚

平台集成 DrugZ、MAGeCK-MLE、MAGeCK-RRA 等多种常用分析方法,不同算法适用于不同筛选场景。用户可根据实验设计与研究目标灵活选择,避免单一算法带来的结果偏差。

3. 灵活定制分析,满足多样需求

无需生信背景,也能实现个性化分析。在平台界面中,可按需选择关注的信号通路、功能基因集或候选基因,并支持基于处理条件、时间点及筛选分组进行分层分析,充分满足科研与药企的差异化需求。

二、标准化操作流程——四步搞定数据分析

1. 登录与任务初始化

进入平台首页完成登录后,可通过两种方式开启分析流程:

· 新建分析:点击“开始分析数据”,从头创建新的分析任务;

· 任务复用:点击“查看缓存数据”,直接调用历史分析结果,避免重复计算。

2. 样本遴选与数据导入

在数据选择界面,勾选目标订单或样本即可,支持跨订单组合分析,方便批次处理。

小提示:点击 “开始分析” 前,建议先下载原始表格,检查字段是否完整、准确,避免后续出错。

3. 项目配置与分组设置

此步骤需要完成 3 项关键配置:

    为项目命名,方便后续管理与识别;

    选择分析方法:支持 MLE、RRA、DrugZ,可根据实验设计灵活选择;

    设置样本分组:为每个样本指定实验组或对照组,确保分组关系清晰、逻辑准确。

4. 运算执行与结果解析

提交任务后,在 “缓存数据” 模块能实时查看分析进度。完成后点击 “查看分析结果”,就能看到四大核心板块:

样本信息概览:快速掌握样本基本情况;

基因差异分析:精准定位差异基因;

火山图可视化:直观呈现差异基因分布;

基因富集分析:解读基因功能与通路。

所有图表都能交互式操作,还能单独下载,方便后续使用。

三、高级分析模块——覆盖多种科研应用场景

1. 基因差异分析
支持正向与负向筛选两种视角,可筛选目标基因并生成排序图谱,同时支持导出完整的差异表达数据列表;右上角检索功能可快速定位目标基因。

2. 火山图可视化
内置交互式筛选工具,便于快速识别显著差异基因,支持正/负视图切换,并可一键下载相关数据。

3. 基因富集分析
集成 KEGG 通路分析与 GO 功能注释,可针对特定通路查看富集基因,帮助更准确地进行功能解读。

4. 多样本队列分析
支持跨批次、跨项目样本的联合分析,尤其适用于多批次实验结果的整合与验证。

✅ 小提示:在进行组合分析前,建议再次检查样本分组设置及数据质量,以确保分析结果的可靠性。

四、常见问题速解

Q1:后续会有更多分析模式吗?

A:会!目前我们已经上线Drug-Z/MAGeCK-MLE/MAGeCK-RRA三大算法,新分析方法正在开发中,尽请期待~

Q2:图表导出失败怎么办?

A:先检查浏览器是否拦截了下载请求;如果还是不行,试试刷新页面或更换浏览器。

Q3:跨订单样本合并后,统计有偏差怎么办?

A:要确保所有样本的测序深度和实验条件一致;必要时,在平台设置中通过 “是否参与分析” 剔除异常样本。

Q4:历史结果怎么复用?

A:路径:“查看缓存数据”→选择目标任务→“查看分析结果”。

Q5:原始数据怎么获取?

A:各分析板块都有 “下载表格数据” 按钮,包含完整字段信息。

Q6:支持哪些物种的富集分析?

A:当前版本仅支持人与小鼠的 KEGG 和 GO 分析。

Q7:遇到技术问题找谁?

A:通过售后反馈通道联系技术支持即可~

ScreenAnlys™ 平台将CRISPR文库筛选中的“数据导入—差异分析—可视化—功能富集解读”整合为一体化标准流程,不仅能够高效复现常规分析步骤,还支持多样本联合分析与交互式图表展示,满足更复杂的科研需求,显著节省时间与精力。
回复此楼

» 猜你喜欢

专注细胞和微生物基因编辑知识分享
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 我太秀了 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见