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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】初次学siesta，就是找不到out文件，请求帮助
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minmin_0082003

金虫 (正式写手)

莫愁莫愁

[交流] 【求助】初次学siesta，就是找不到out文件，请求帮助

整个实验室就我跟助教用这个软件，助教还不怎么搭理人.....求救
输入文件如下
“SystemName          Water molecule, using order-N method
SystemLabel         h2o
NumberOfAtoms       3
NumberOfSpecies     2

%block ChemicalSpeciesLabel
1  8  O      # Species index, atomic number, species label
2  1  H
%endblock ChemicalSpeciesLabel

AtomicCoordinatesFormat  Ang
%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
0.000  0.000  0.000  1
0.757  0.586  0.000  2
-0.757  0.586  0.000  2
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies

SolutionMethod   ordern”
运行的命令 siesta h2o.sdf&
然后出现了COLCK这个文件，是怎么回事呢？
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1楼 2009-11-16 15:15:08
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redskywei

木虫 (著名写手)
★ ★
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zxzj05(金币+1,VIP+0):讨论奖励！ 11-17 22:03
建议用手册上的标准命令~~~
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坠入无边的网~~
2楼2009-11-17 11:20:27
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minmin_0082003

金虫 (正式写手)

莫愁莫愁
这个就是我从手册上找到啊~~~
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3楼2009-11-17 16:04:17
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xhsh

木虫 (小有名气)
★ ★
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zxzj05(金币+1,VIP+0):讨论奖励！ 11-17 22:03
siesta < h2o.fdf

或
siesta h2o.out
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4楼2009-11-17 16:34:49
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redskywei

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjmaxpayne(金币+2,VIP+0):谢谢分享 11-18 15:00
引用回帖:
Originally posted by minmin_0082003 at 2009-11-17 16:04:
这个就是我从手册上找到啊~~~

最开始介绍siesta的使用的地方，命令肯定不是这样的。一般是siesta aa.out

或者给出绝对路径  nohup ~/~/~/siesta aa.out run.log &

[ Last edited by redskywei on 2009-11-18 at 09:33 ]
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坠入无边的网~~
5楼2009-11-18 09:28:03
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minmin_0082003

金虫 (正式写手)

莫愁莫愁
引用回帖:
Originally posted by redskywei at 2009-11-18 09:28:


最开始介绍siesta的使用的地方，命令肯定不是这样的。一般是siesta aa.out

或者给出绝对路径  nohup ~/~/~/siesta aa.out run.log &

[ Last edited by redskywei o ...

谢谢
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6楼2009-11-18 09:57:05
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dtlfnwu

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
应该是输入文件有错误.
如果运行时用的是siesta name.out
而没有*.out文件的话,查看一下siesta.sh.e*这个里面会有错误提示.
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2009-11-19 11:21:46
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