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木虫 (正式写手)

[交流] 如何预测基因片段长度

各位同仁：
   你们好。
   我做基因克隆实验，已经拿到一个中间片段，做3’RACE的时候，遇到了问题，调了好几次，测序都不是想要的结果。我想问一下各位，如何预测3’长度，在中间片段已知的情况下。
   希望各位同仁提出宝贵建议，不胜感激。

1楼2009-11-16 09:38:17

铜虫 (小有名气)

★ ★
rkrl001(金币+2,VIP+0):非常感谢。 11-17 11:16

将你的中间片段翻译成氨基酸后，在NCBI上blast一下，你会发现有很多其他物种的同源序列，然后看一下你的氨基酸大致位于其他同源序列的哪个位置，其之前大概有多少氨基酸，之后有多少氨基酸就知道了，然后换算成核苷酸数，就是你想要的答案了。
这是我的愚见，不知对你有没有参考价值

3楼2009-11-16 11:06:02

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