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铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】如何把pdb文件转化为gjf文件

我从一篇文献给出的Accession Codes中有几个PDB文件，但用GV打开时很大，里面还包括了溶剂分子等，一大团，就像算分子动力学似的。但文献里给的单个的分子有不大，我如何从PDB文件取出单个的分子，转化成单个分子的输入文件？

1楼 2009-11-15 22:17:12

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至尊木虫 (职业作家)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-16 09:30

1.用gaussview打开，ctrl+x所要的分子，再ctrl+v到新的文件中。
2.用gaussview打开，删去不要的原子，ctrl+x所要的分子，再ctrl+v到新的文件中。
3.直接删PDB中不想要的原子。

2楼2009-11-16 08:59:24

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