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科研战神来了

新虫 (小有名气)

[交流] GST pulldown 实验步骤及结果解读~ 已有1人参与

一、实验前准备与样品制备
1.试剂与材料
缓冲液:
裂解缓冲液:50mMTris-HCI(pH8.0),150mMNaC1,1%NP-40(或 TritonX-100),可用并添加新鲜的蛋白酶抑制剂(如 PMSF,Cocktail)和磷酸酶抑制剂(如研究磷酸化相关)洗涤缓冲液:同上但不加蛋白酶抑制剂;为降低背景,可提高盐浓度(如500mMNaCl)或加入 0.1%SDS
洗脱缓冲液:50mMTris-HCI(pH8.0).20mM 还原型谷胱甘肽;或直接使用2xSDS-PAGE 上样缓冲液。
珠子:谷胱甘肽琼脂糖珠或磁珠。
蛋白样品:
诱饵蛋白:纯化的GST-A(实验组)和纯化的GST蛋白(阴性对照组)。
猎物蛋白:含有目标互作蛋白的细胞裂解液或纯化蛋白 His-B
2.诱饵蛋白准备
表达并纯化 GST-目标蛋白和空 GST 标签蛋白(对照用),分装冻存于-80°C。
3.细胞裂解液制备
培养并收集一个10com圆皿细胞,预冷PBS洗涤细胞两次;加入500L预冷的裂解缓冲液,冰上孵育15-30分钟;用细胞刮刮下细胞,转移至预冷的离心管;4°C,14000g 离心10分钟小心吸取上清(即总蛋白裂解液),测定浓度,分装备用二、Pull-down 核心步骤
4.平衡珠子
轻轻重悬谷胱甘肽珠子,吸取50wL 珠子悬液到1.5mL 离心管中,用1mL 预冷的裂解缓冲液洗涤珠子3次(离心:4°C,500-1000g,1-2min),去除储存液中的乙醇。
5.偶联诱饵蛋白(固定化)
取10ug纯化的GST-目标蛋白和 GST蛋白分别与平衡好的珠子混合;在4°C旋转摇床上孵育1-2小时,使GST与珠子充分结合;离心弃上清,用裂解缓冲液洗涤珠子3次,去除未结合的蛋白;此时,诱饵蛋白己固定在珠子上
6.孵育结合(“钓鱼”过程)
将预清除后的细胞裂解液等量(1mg 蛋白量)加入已偶联了GST-目标蛋白和GST 蛋白的两份珠子中。在4°C旋转摇床上孵育2-4小时或过夜。若猎物蛋白为纯化蛋白,则在此步加入10ug纯化的 His-B 蛋白
三、洗涤、洗脱与检测
7.洗涤
离心,小心吸弃上清;用预冷的洗涤缓冲液重悬珠子,旋转孵育3-5分钟;离心,弃上清;
重复此步骤3-5次。第一次洗涤可温和,后续洗涤可逐渐提高盐浓度或加入低浓度去垢剂以去除非特异结合。
8.洗脱与样品制备
吸尽最后一次洗涤液,直接加入20-40uL 1×或 2×SDS-PAGE 上样缓冲液,涡旋混匀后95-100°C煮沸5-10min(膜蛋白室温变性30min),使蛋白从珠子上变性脱落。
9.检测
将样品进行 SDS-PAGE 电泳;
阳性结果:在“GST-目标蛋白”组中能检测到猎物蛋白条带,而在“GST 空标签”对照组中检测不到或信号极弱。
四、注意事项
蛋白纯化的注意事项
所有操作必须围绕保持蛋白天然构象和生物活性展开。
一、实验设计阶段
表达系统匹配:
大肠杆菌:快速、经济,但无真核修饰,易形成包涵体。
真核系统:可获得正确折叠和修饰的蛋白,但周期长、成本高。
选择依据:下游应用决定。如Pull-down验证可用原核表达:药物靶点研究需真核表达。
标签策略:
GST标签:增加可溶性,但可能干扰蛋白功能,纯化后建议切除。
His标签:分子量小,对结构干扰小。
二、操作过程关键点
全程低温:4°C环境操作,缓冲液预冷。
抑制蛋白酶:必须添加新鲜的蛋白酶抑制剂混合物
避免氧化与聚集:添加I-10mM DTT或TCEP(注意TT会破坏琼脂糖珠,结合前需去
除)。
对疏水蛋白,添加0.01%-0.1%非离子去垢剂(如Tween-20)。
彻底去除核酸:细菌裂解液中加入Benzonase核酸酶,减少非特异性结合。
温和洗脱:采用梯度洗脱而非一步洗脱。
收集洗脱峰后立即置于冰上,并快速置换缓冲液(脱盐柱/透析)。
三、质量控制与保存
必须做的质检:
SDS-PAGE:验证纯度和分子量。
Western Blot:确认目标蛋白身份。
活性测定:最关键的一步!纯化后立即用功能实验验证(如酶活、Pull-down结合实验)。
分装保存:小体积分装,避免反复冻融。
五、实验结果解读
GSTpull-down实验
GSTpull-down的原理是利用谷胱甘肽S-转移酶(GST)与谷胱甘肽(GSH)之间的高亲和力,将GST融合蛋白固定在谷胱甘肽包被的琼脂糖珠上,作为“诱饵”,用于捕获与之相互作用的“捕获蛋白”。此方法常用于体外检测蛋白相互作用
两种Pull-down实验的区别

GST pulldown 实验步骤及结果解读~
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1974707632

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我们用magarose-GST磁性琼脂糖珠,效果不错

发自小木虫IOS客户端
2楼2026-03-06 22:00:50
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