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lxyyzz木虫 (小有名气)
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测序比对的问题，求助！
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测序比对的结果，由于差两个碱基，要比对下氨基酸是不是一样。 我的序列是从小到大，与NCBI上序列比对是从大到小， 都说要把测序的结果反向互补下再比对，这个原理是什么呢？按照思维好像应该是只反向啊。 反向互补后和原来的序列完全不一样啊，为什么仍然可以比对呢？而只反向比对的结果却是不一样的。 另外反向互补到另外一条链，翻译的氨基酸也就不一样了啊，怎么能确定自己的序列是不是正确呢？ 想不通啊…… |
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木虫 (正式写手)
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lxyyzz(金币+5,VIP+0):谢谢！我基本懂了~ 11-13 19:47
lxyyzz(金币+5,VIP+0):谢谢！我基本懂了~ 11-13 19:47
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测序的原理其实还是基于合成，就是只能从5‘到3’。 转录只是利用双链中的一条单链，另一条是无意义的。 DNA是反向互补的双链，假设用a和b代表基因的两端，如果正向测的话没有问题，测的作为模版的单链，5'到3'的序列肯定就是a端到b端，这和NCBI上结果应是一致的。 反向测的话就要测定另一条单链，即非模板链。对于非模板链来说，根据反向平行的原则，a端是其3’端，而b端是其5‘端。测序只能从5’端到3‘端，也就是相当于从b到a，或者说是从右往左。因而与模板链反向并且互补。 关键是要理解3’与5‘。 |
2楼2009-11-13 16:25:05