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当Biacore 8K遇上92个临床血清样本
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上个月接了临床合作项目，要用Biacore 8K筛一批92例的临床血清样本。原本想着高通量是这台仪器的强项，真做起来才发现事情没那么简单。 样本前处理就给了个下马威。血清基质干扰大，直接上机基线飘得没法看。最后还是用蛋白A/G预处理，加上适当稀释才稳住信号。但稀释度一高，弱阳性样本就容易漏检，这个平衡点折腾了好几天。 最头疼的是样品针携带污染。即便设了加强清洗程序，连续进样几十例后，阴性对照的信号还是会有轻微上漂。后来在每10个样本后插入一次空白再生，情况才好转。Biacore 8K的8通道确实能并行检测，但血清样本的交叉污染风险比纯化蛋白大得多。 数据量也是个挑战。92个样本，每个样本多循环检测，一晚上跑出近千条传感图。虽然自带软件能批量处理，但筛选中的假阳性判断还是得一条条曲线肉眼过。连续看了两天曲线图，眼睛都花了。 不过效率确实惊人。同样的样本量，用单通道仪器得跑一周，Biacore 8K两个晚上就收工了。只是高通量筛选和精细动力学分析终究是两码事，方法优化上还有很多要摸索的地方。 想问问论坛里做过临床样本高通量筛选的老师，有没有什么经验可以分享？特别是基质干扰和交叉污染的控制，有没有更好的解决方案？ |
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