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清风一郎

铜虫 (初入文坛)

[求助] QE计算分子晶体的拉曼光谱,运行ph.in报错 已有1人参与

各位老师好!
我在用quantumespresso计算一个分子晶体的拉曼光谱,在运行ph.in文件时,运行一段时间后,遇到如下报错,请问可能是什么原因引起的呢?


error in routine d2ionq_dispd3 (1):
the hessian file: ./tmp/cbp-alpha.hess is missing.


以下为ph.in的输入文件

&inputph
  tr2_ph = 1.0d-14
  prefix = 'cbp-alpha'
  outdir = './tmp'
  fildyn = 'cbp-alpha'
  ldisp = .false.
  epsil = .true.
  trans = .true.
  qplot = .false.
  nq1 = 1, nq2 = 1, nq3 = 1
/
0.0 0.0 0.0


以下为上一步scf计算的pw.in输入文件

&control
  title='cbp-alpha-scf',
  calculation='scf',
  prefix = 'cbp-alpha'
  pseudo_dir='./',
  outdir='./tmp',
  verbosity='high',
/
&system
  ibrav= 0, nat= 124, ntyp= 3,
  occupations = 'fixed',
  ecutwfc = 80,
  ecutrho = 800,
  vdw_corr = 'grimme-d3',
/
&electrons
  conv_thr = 1.0d-10
  mixing_beta = 0.5d0
/
&ions
/
&cell
/
atomic_species
  c 12.0107 c.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.upf
  h 1.00794 h.pbe-rrkjus_psl.1.0.0.upf
  n 14.00674 n.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.upf
cell_parameters (angstrom)
   8.459549526   0.000000000  -0.013055016
   0.000000000  15.662496878   0.000000000
  -3.735405692   0.000000000   9.404073167
atomic_positions (crystal)
c                0.9391414775        0.6511901948        0.0001336347
c                0.3784976529        0.9006437189        0.0155178630
h                0.7757116114        0.2124087035        0.0187583199
h                1.0019841321        0.5897111019        0.0306536179
c                0.9206504794        0.8052563194        0.0383402022
c                0.5506940455        0.0355539285        0.0435877664
c                0.7189543912        0.1652396522        0.0665723707
h                0.6325579656        0.4887538700        0.0548401428
h                0.8993127218        0.9906024777        0.0795285774
h                0.6023302268        0.3313104779        0.0765492092
c                0.0024835333        0.7250014214        0.0795842995
c                0.2261448565        0.1888536358        0.0848644218
h                0.3951836956        0.9024270494        0.1273945662
c                0.2063954886        0.3409479726        0.1226546038
h                0.2897961331        0.1277071056        0.1175317552
h                0.3012245132        0.6118530530        0.1146420810
c                0.0201530199        0.8672945206        0.1411095687
c                0.7292089644        0.4535095030        0.1395458206
h                0.2897961331        0.3722928944        0.6175317552
h                0.3012245132        0.8881469470        0.6146420810
c                0.0201530199        0.6327054794        0.6411095687
c                0.7292089644        0.0464904970        0.6395458206
c                0.0060365193        0.5444443856        0.6545881225
c                0.7123141847        0.1346406675        0.6496738235
c                0.2885512487        0.2379342436        0.6651907325
h                0.2546885844        0.1027339140        0.6882598666
c                0.5811894619        0.4575321578        0.6897656561
n                0.1472689194        0.7637812090        0.7040610279
c                0.7493496897        0.3299254200        0.7119607479
h                0.5258479272        0.5034909736        0.7409130304
c                0.3216422077        0.8918055436        0.7271974022
h                0.8773951383        0.9330155564        0.7239177372
c                0.1596653066        0.6772655983        0.7411508941
c                0.8685822085        0.0017679097        0.7353366102
h                0.4011250486        0.2417865996        0.7628008744
h                0.5988749514        0.7417865996        0.7371991256
c                0.1314177915        0.5017679097        0.7646633898
c                0.8403346934        0.1772655983        0.7588491059
h                0.1226048617        0.4330155564        0.7760822628
c                0.6783577923        0.3918055436        0.7728025978
h                0.4741520728        0.0034909736        0.7590869696
c                0.2506503103        0.8299254200        0.7880392521
n                0.8527310806        0.2637812090        0.7959389721
c                0.4188105381        0.9575321578        0.8102343439
h                0.7453114156        0.6027339140        0.8117401334
c                0.7114487513        0.7379342436        0.8348092675
c                0.2876858153        0.6346406675        0.8503261765
c                0.9939634807        0.0444443856        0.8454118775
c                0.2707910356        0.5464904970        0.8604541794
c                0.9798469801        0.1327054794        0.8588904313
h                0.6987754868        0.3881469470        0.8853579190
h                0.7102038669        0.8722928944        0.8824682448
c                0.7936045114        0.6590520274        0.8773453962
h                0.6048163044        0.0975729506        0.8726054338
c                0.7738551435        0.8111463642        0.9151355782
c                0.9975164667        0.2749985786        0.9204157005
h                0.3976697732        0.6686895221        0.9234507908
h                0.1006872782        0.0093975223        0.9204714226
h                0.3674420344        0.5112461300        0.9451598572
c                0.2810456088        0.8347603478        0.9334276293
c                0.4493059545        0.9644460715        0.9564122336
c                0.0793495206        0.1947436806        0.9616597978
h               -0.0019841321        0.4102888981        0.9693463821
h                0.2242883886        0.7875912965        0.9812416801
c                0.6215023471        0.0993562811        0.9844821370
c                0.0608585225        0.3488098052        0.9998663653
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QE计算分子晶体的拉曼光谱,运行ph.in报错
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Everyone overestimates what you can do in a day and underestimates what you can do over the course of months or a year
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HER12025

铁虫 (小有名气)

同学你好,是否需要代算?
2楼2026-01-12 18:04:51
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rlafite

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你在 ph.x 中启用了 Grimme-D3 色散修正 (vdw_corr='grimme-d3'),
但 当前的 DFPT (ph.x) 并没有生成或找到 D3 所需的 Hessian 文件,
因此在计算拉曼(需要二阶导数)时直接报错退出。
vdw_corr = 'grimme-d3'
这是 经验色散项,不是严格的 Kohn–Sham 泛函的一部分。

拉曼强度需要:力常数矩阵(Hessian)/ 极化率对应变的导数

而当你开启 D3 时:D3 对能量有贡献 / 对力有贡献 / 对 Hessian 也有贡献

问题在这里👇
QE 的 ph.x 并不会自动为 D3 构造 Hessian
3楼2026-01-13 02:25:29
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rlafite

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

声子 / 拉曼计算时关掉 D3
做法:
SCF 结构优化阶段:用 vdw_corr='grimme-d3'

最终 SCF + ph.x 阶段:不用 D3

实际操作
1️⃣ 再跑一个 不含 D3 的 SCF
vdw_corr = 'none'
保持:样的结构, 同样的 cutoff, 同样的 prefix / outdir(或新的也可以)

2️⃣ 用这个 SCF 接 ph.x
这是目前文献中最常见、审稿人完全接受的做法
拉曼频率对 vdW 修正通常不敏感;  vdW 更重要的是几何结构
4楼2026-01-13 02:29:21
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