| 查看: 10515 | 回复: 0 | ||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者gdykdxzyc将赠送您 25 个金币 | ||
[求助]
各位老师、同学好：
我在进行纤维素酶（cellulas...
|
||
|
各位老师、同学好： 我在进行纤维素酶（cellulase）二级结构分析时，采用了圆二色谱（CD）测试，并使用 CRDATA.EXE 和 SELCON3.EXE 对光谱进行反卷积计算。但在使用过程中发现，这两款软件内置了多组数据库（SP29、SP22X、SP37、SP43、SP37A、SDP42、SDP48、CLSTR、SMP50、SMP56 等），这些数据库的参考蛋白数量、波长范围以及是否包含变性或膜蛋白等信息都有所不同。 由于纤维素酶属于可溶性酶蛋白，（并且他的是一个复合蛋白）该怎么去确定他的残基数呢，在不同溶剂体系（如 DES/缓冲液混合溶液）中结构可能发生变化，我目前对于 应当选择哪个数据库进行拟合 仍然存疑。 想向各位请教： ? ? ? ? 1.? ? ? ? 在分析纤维素酶这类可溶性酶蛋白时，通常推荐使用哪一类数据库？ 例如 SP29 / SP37 / SP43 是否更常用？ ? ? ? ? 2.? ? ? ? 如果溶剂环境（如 DES）可能导致部分构象松散或类变性状态，是否需要考虑 SDP42 / SDP48 或 CLSTR 等包含变性蛋白的数据库？ ? ? ? ? 3.? ? ? ? 大家在使用 CRDATA.EXE / SELCON3.EXE 时，有没有筛选数据库的经验？ 是否以光谱波长范围、蛋白类型（可溶 / 变性 / 膜蛋白）、数据拟合残差等作为主要判断依据？ ? ?? ? 4.? ? 对于纤维素酶这个复合型蛋白，我该怎么去确定它的残基数呢？ ? ? ? ? 5.? ? ? ? 如果您有相关的参考论文或操作建议，也非常欢迎推荐。 目前正在进行的工作需要尽量准确地量化纤维素酶在不同溶剂环境下的 α-helix / β-sheet / β-turn / unordered 变化，因此数据库选择非常关键。希望能向有经验的老师和同学学习。 感谢各位的时间！ @是水货 发自小木虫IOS客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
国社科又开始会评了，不知道这次命运如何
已经有14人回复
-
基金评审意见有问题
已经有5人回复
-
食品科学论文润色/翻译怎么收费?
已经有281人回复
-
根癌农杆菌A136
已经有1人回复
-
🔥颠覆认知｜缺镁，可能悄悄偷走你的好心情
已经有0人回复
-
安徽省基金今年为什么开始的这么晚，本子什么时候送审，各位大神有了解的吗
已经有3人回复
-
Invitation to Explore China's Qiming Talent Program
已经有2人回复
-
中国启明计划// China's Qiming Talent Program
已经有0人回复
-
【专题讨论】果糖代谢科普辨析：天然水果果糖不等同于添加果糖，适合营养实训教学案例
已经有0人回复
-
北京工商大学曹锦轩课题组招收2027年博士生
已经有206人回复
