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各位老师、同学好：
我在进行纤维素酶（cellulas...
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各位老师、同学好： 我在进行纤维素酶（cellulase）二级结构分析时，采用了圆二色谱（CD）测试，并使用 CRDATA.EXE 和 SELCON3.EXE 对光谱进行反卷积计算。但在使用过程中发现，这两款软件内置了多组数据库（SP29、SP22X、SP37、SP43、SP37A、SDP42、SDP48、CLSTR、SMP50、SMP56 等），这些数据库的参考蛋白数量、波长范围以及是否包含变性或膜蛋白等信息都有所不同。 由于纤维素酶属于可溶性酶蛋白，（并且他的是一个复合蛋白）该怎么去确定他的残基数呢，在不同溶剂体系（如 DES/缓冲液混合溶液）中结构可能发生变化，我目前对于 应当选择哪个数据库进行拟合 仍然存疑。 想向各位请教： ? ? ? ? 1.? ? ? ? 在分析纤维素酶这类可溶性酶蛋白时，通常推荐使用哪一类数据库？ 例如 SP29 / SP37 / SP43 是否更常用？ ? ? ? ? 2.? ? ? ? 如果溶剂环境（如 DES）可能导致部分构象松散或类变性状态，是否需要考虑 SDP42 / SDP48 或 CLSTR 等包含变性蛋白的数据库？ ? ? ? ? 3.? ? ? ? 大家在使用 CRDATA.EXE / SELCON3.EXE 时，有没有筛选数据库的经验？ 是否以光谱波长范围、蛋白类型（可溶 / 变性 / 膜蛋白）、数据拟合残差等作为主要判断依据？ ? ?? ? 4.? ? 对于纤维素酶这个复合型蛋白，我该怎么去确定它的残基数呢？ ? ? ? ? 5.? ? ? ? 如果您有相关的参考论文或操作建议，也非常欢迎推荐。 目前正在进行的工作需要尽量准确地量化纤维素酶在不同溶剂环境下的 α-helix / β-sheet / β-turn / unordered 变化，因此数据库选择非常关键。希望能向有经验的老师和同学学习。 感谢各位的时间！ @是水货 发自小木虫IOS客户端 |
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