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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 帮我分析一下这个基因的信号肽在哪里?
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维纳斯的骑士

金虫 (小有名气)

[交流] 帮我分析一下这个基因的信号肽在哪里?

帮我分析一下下面这个基因的信号肽位置在哪里,谢谢!

ATGGCTATGATACCTTCAATTTCAAAGTTGCTTTTTGTTGCAATATGTCTTTTTGTTTATATGGGTTTGTCATTTGGTGATTTTTCTATTGTGGGTTATTCTCAAAATGACTTGACATCCACTGAAAGACTTATTCAGCTATTTGAATCGTGGATGTTGAAGCACAATAAAATTTATAAAAATATTGATGAGAAAATCTACAGATTTGAAATTTTTAAAGATAATCTTAAATATATTGATGAGACAAATAAGAAGAATAACAGTTATTGGCTTGGATTAAATGTGTTTGCTGATATGAGCAATGATGAATTCAAAGAAAAGTATACTGGTTCTATTGCTGGAAATTATACAACAACCGAACTATCATACGAAGAAGTGCTTAATGATGGTGATGTAAATATCCCGGAGTATGTCGATTGGAGACAAAAAGGAGCTGTCACTCCTGTAAAAAATCAGGGTTCTTGTGGTAGTTGTTGGGCATTCTCAGCTGTTGTAACTATAGAGGGAATAATTAAGATTAGAACTGGAACTTAAATGAATACTCAGAGCAAGAACTGCTTGACTGCGACAGACGTAGCTACGGGTGCAATGGAGGTTACCCTTGGAGTGCACTTCAATTAGTGGCTCAATATGGTATTCACTACAGAAATACTTACCCATATGAGGGAGTGCAACGTTATTGTCGCTCAAGGGAGAAAGGTCCTTATGCAGCCAAAACCGATGGGGTTCGACAAGTGCAACCATATAATGAAGGGGCTCTCTTATATTCAATTGCAAACCAACCTGTGAGCGTTGTCCTTGAAGCTGCTGGAAAAGATTTCCAATTATATAGAGGGGGAATATTTGTGGGGCCATGCGGAAACAAAGTAGATCATGCAGTCGCAGCAGTTGGGTATGGACCAAATTACATACTCATAAAGAATTCATGGGGTACAGGATGGGGTGAAAATGGATATATAAGAATCAAAAGAGGCACTGGAAACTCCTATGGAGTATGTGGACTTTATACAAGCTCATTCTATCCTGTTAAAAACTGA

能告诉我确切的信号肽位置吗?
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1楼 2009-11-11 23:01:08
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维纳斯的骑士

金虫 (小有名气)
真核来源的基因,qgaoamtf 的# Most likely cleavage site between pos. 26 and 27: SFG-DF, 在基因序列中是第26-27个核苷酸之间,还是第26-27个氨基酸之间呢?主要就是从ATG开始到哪个核苷酸之间是信号肽序列,请教了
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4楼2009-11-12 10:05:31
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qgaoamtf

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★
sutao1979(金币+3,VIP+0):有好多的数据库网站可以预测，这个也不错 11-12 03:32
真核？原核？革兰氏阴性，阳性？

# Most likely cleavage site between pos. 26 and 27: SFG-DF

http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
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2楼2009-11-11 23:39:45
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kitty8682

金虫 (正式写手)
把这个序列输到NCBI中有信号肽预测的网站，直接就出来了
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3楼2009-11-12 09:03:50
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qgaoamtf

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
SFG-DF: 第26-27个氨基酸之间. 根据网站预测结果，信号肽序列为：
ATGGCTATGATACCTTCAATTTCAAAGTTGCTTTTTGTTGCAATATGTCTTTTTGTTTATATGGGTTTGTCATTTGGT
仅供参考。
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5楼2009-11-12 14:11:10
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