24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 78  |  回复: 0

xxxgdragon

新虫 (初入文坛)

[交流] 计算化学与人工智能驱动的MOFs性能预测与筛选技术

第一部分

AI与MOF计算基础及环境搭建 1.关键理论:

1.1.AI 在计算化学中的范式革新:从计算化学到深度学习

1.2. MOF结构-功能关系解析:从金属节点、有机配体的化学特性到宏观吸附、分离性能

1.3.科学计算与AI工作流整合:数据获取(DB)→结构清洗(Code)→特征计算(Tool)→模型训练(AI)的标准流程

1.4.量子化学基础:DFT在MOF结构优化、电子结构与吸附位点分析中的应用

案例实践1:

Case 1:使用MOSAEC算法处理CoRE-MOF、QMOF数据库,进行结构合理性校验与数据清洗,确保所有结构满足化学合理性

Case 2:使用Zeo++计算 MOF 孔结构特征(比表面积、孔隙率等)

Case 3:拓扑分析与化学描述符(开放金属位点、有机配体结构式)批量提取

Case 4:使用CP2K完成MOF的晶体结构优化,并计算CH4的结合能,为机器学习筛选出来的潜在候选物进行机理解释。

第二部分

分子模拟和高通量计算在MOFs中的应用 2.关键理论:

2.1.分子模拟核心:力场与电荷分配的物理意义与选择策略

2.2.分子模拟在揭示MOF吸附与分离机制(吸附位点、扩散路径)中的作用

2.3.高通量计算:作为AI模型“数据工厂” 的搭建流程与MOF 设计中的应用

案例实践2:

Case 1:使用 RASPA2 计算气体吸附/分离性质

Case 2:使用 RASPA2计算等温吸附曲线和气体吸附概率密度图

Case 3: 使用GPU加速的gRASPA实现高通量GCMC模拟,体验“计算产生数据”的规模与效率,并构建后续所需数据集

Case4:高通量GCMC计算结果的分析与可视化,提取结构-性能对应关系。

文献复现:复现经典文献的高通量筛选流程,讨论如何将结果作为AI模型的输入

Large-scale screening of hypothetical metal–organic frameworks. Nature Chem 2012, 4, 83–89 DOI: 10.1038/nchem.1192

第三部分

传统机器学习与可解释AI在MOF中的应用 3.理论部分

3.1.机器学习在MOF中的QSAR/QSPR模型:结构-性质定量关系

3.2.特征工程核心:化学描述符(比表面积、孔径等)的物理意义

3.3.算法深度解析:随机森林(RF)、XGBoost、SVM在吸附预测中的优劣

3.4.可解释AI前沿:SHAP、SISSO 在挖掘物理机制与发现设计规则中的应用

案例实践3:

Case 1:Python实现XGBoost、SVM、RF模型预测MOF气体吸附分离性质

Case 2:使用贝叶斯优化算法进行参数调优与特征选择

Case 3:基于独立筛选和稀疏算子 (SISSO) 算法从高维特征空间中学习简洁且可解释的物理公式

Case 4:可视化结果:AUC曲线、误差散点图、蜜蜂群图

Case 5:预测未知MOF的吸附性质,验证模型泛化能力

文献复现:Robust Machine Learning Models for Predicting High CO2 Working Capacity and CO2/H2 Selectivity of Gas Adsorption in Metal Organic Frameworks for Precombustion Carbon Capture J. Phys. Chem. C 2019, 123, 7, 4133–4139 DOI: 10.1021/acs.jpcc.8b10644

第四部分

图神经网络(GNN)与MOF结构-性能建模 4.理论部分

4.1.GNN基础:如何将晶体结构表示为图—节点、边与全局状态的化学信息编码

4.2.主流GNN模型:CGCNN、MEGNet消息传递机制及在MOF建模中的优势

4.3.节点/边特征构建:化学键、配位环境、拓扑连通性的编码策略

4.4.GNN的可解释性:如何理解GNN“看到”的化学信息

案例实践4:

Case 1:使用Pymatgen将MOF晶体结构转换为图神经网络所需的张量数据

Case 2:训练CGCNN或MEGNet模型,预测MOF的吸附性能,并与传统ML对比

Case 3:GNN可视化:使用t-SNE或主成分分析模型学习到的结构表征

Case 4:利用训练好的GNN模型,对虚拟MOF数据库(如hMOF)进行快速性能筛选与候选材料推荐

文献复现:Hydrogen storage metal-organic framework classification models based on crystal graph convolutional neural networks, Chemical Engineering Science 2022, 259, 117813. DOI: 10.1016/j.ces.2022.117813
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xxxgdragon 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见