中国科学院杭州医学研究所(https://him.cas.cn/)是中国科学院直属的中央事业单位,也是浙江省重点引进和打造的生命健康科创高地主平台。医学所充分发挥中国科学院体系化建制化优势、浙江省经济发展和创新生态优势,履行国家医学领域战略科技力量的使命担当,努力建设生命健康领域国际一流原始创新策源地,打造一流成果、广聚一流人才、成就一流事业。
课题组简介
人工智能与智慧医疗(AIM)中心协同核酸分子医学、华大生命组学、创新药物、合成生物学、临床转化医学等团队,以及附属肿瘤医院各个专科临床,发挥国家肿瘤区域医疗中心的肿瘤大数据和生物样本资源优势、BT+AI人才聚集优势,围绕医疗大数据安全共享和深度挖掘的关键共性问题,立足于生物医药和多组学大数据,聚焦恶性肿瘤等重大疾病的精准诊疗和药物发现,搭建生物医药基础大模型及智能体平台,开展AI算法及平台、全链条智能药物发现、多模态智能诊疗等研发,推进前沿人工智能技术与生物医药领域的突破性进展。AIM现已建成由李晓林教授领衔,核心研究员、算法工程师、博士后及硕博研究生组成的 80多人研究团队,科研经费和计算资源充足(GPU集群拥有A**8卡, H**8 卡等数十个节点和200G IB交换机;投入数千万元)。欢迎访问主页https://aimlab.cc/,了解更多信息。
李晓林,中国科学院杭州医学研究所人工智能首席科学家。曾任美国佛罗里达大学终身正教授,计算机工程部主任,牵头创立全美首个国家级深度学习中心并任创始主任(四校联盟: UF, CMU, UO, UMKC, 80多位国际知名教授; 30多家国际知名企业会员: 英伟达、谷歌、礼来、百度、腾讯、网易、平安等)。获得美国国家科学基金杰出青年教授奖NSF CAREER Award,被评为中国人工智能年度十大风云人物,获得多篇最佳会议/杂志论文,获得多个挑战赛冠军。牵头搭建全美最快 200G 校园科研网;参与促成英伟达捐赠数千万美元,打造成全球高校第一智算中心;牵头获批科技部国家新一代人工智能开放创新平台。主导开发智能平台(CognitiveEngine,DeepCloud, GatorCloud, AgentStore)、蛋白折叠及靶点发现(PrimateAI,DeepFolding,FoldingZero)、智能诊断(DeepBipolar,DeepCancer, MySurgeryRisk,CellStory, Dr. Copilot)、智能药物发现(DeepAtom,DyScore,DrugMetric,BatmanNet,AptaDiff,RNADiffFold,AtomicFold, AtomicVax)、 科研助理(Insage, ScholarClub, LifeStudio)、联邦学习(FLEX, iBond)等多个AI算法和平台,在人工智能、深度学习、生物医药、云计算、安全隐私等领域的国际顶级期刊和会议发表论文200余篇。研究成果被有效应用于靶点发现、蛋白质和核酸结构预测、药物发现、多组学、病理影像和临床决策支撑系统。培养的学生有多位成为美国知名高校长聘教授(包括全美排名前五的药学院)。
沙雏淋,特聘副研究员,中国科学院“百人计划”研究员,浙江省海外高层次引进人才。博士毕业于英国利兹大学,2021年加入中国科学院杭州医学研究所。从事AI驱动的肿瘤多组学精准医学研究,主要方向包括:1)肿瘤单细胞、空间多组学人工智能算法开发;2)细胞大模型开发和应用;3)AI驱动的基因调控网络模拟,以及肿瘤新机制新靶点发现。以第一和通讯作者在JCO、Leukemia、MIA、AAAI等顶级期刊和会议发表论文十余篇。主持和参与国自然项目,国自然重点区域项目、国家重点研发项目,中国科学院先导项目等多项重要研究。
黄俊杰,特聘副研究员,博士生导师,浙江省高层次青年人才,BMEMat青年编委。主持国自然面上项目、青年项目,省自然重大项目。近年来以第一作者在Nat. Biomed. End., Nat. Commun.等期刊发表论文8篇,授权专利5项。曾获杭州青山湖材料基因工程青年科学家奖(中国工程院主办会议)、浙江大学国际联合学院优秀学术成果奖、浙江大学国际联合学院年度学术新人奖。研究方向为:1)知识嵌入模型赋能抗菌肽从头设计;2)大模型赋能个性化肿瘤疫苗设计;3)分子大模型赋能小分子药物设计。
韩玉强,特聘副研究员。于浙江大学计算机学院获得博士学位,并先后在浙江大学和香港中文大学从事博士后研究。主要研究方向为深度学习和 AI for Science,重点聚焦于人工智能在小分子药物设计与合成、肿瘤新抗原发现、以及纳米抗体设计等生物医药前沿领域的应用。以第一作者或通讯作者身份在 Nat. Commun.、ACL 等国际高水平期刊和会议上发表学术论文十余篇,并获授权发明专利5项。
张俊伟,助理研究员。2023年于天津大学智能与计算学部获得工学博士学位,随之加入杭州医学所参加工作。主要从事大语言模型、自然语言处理、量子机器学习、智慧医疗、AI for Life Science 等领域的研究课题。近年来以第一作者身份在 AAAI、CIKM、ECAI 等高水平人工智能会议上发表二十余篇学术论文,获得多项发明专利和团体标准,申请数十项软件著作权(包括主导研发的 scholar.club、LifeStudio 等信息化平台),并担任 Information Sciences、AAAI、IJCAI、ECAI、EMNLP、DASFAA 等知名期刊和会议的审稿人。此外,与阿里巴巴、字节跳动等头部IT企业深度合作,推动自研模型在生产环境中部署与应用,实现技术到产业的转化。
研究方向
1. AI算法及基础大模型
探索和应用最前沿的人工智能算法和可信智能平台技术,搭建基础大模型及智能体平台(包括LLM、Multimodal GenAI、Generative Agent etc.),为智慧医疗构建可信AI基础设施,打造下一代基础模型及智能科学生态,搭建智能科研助理 (Research Copilot)。目前重点在于大语言模型、智能体、深度学习、强化学习、NLP、CV、KG、搜索、推荐、联邦学习等算法应用及平台。
2. 全链条智能药物发现
利用前沿人工智能技术(特别是深度学习、强化学习、生成式AI、基础大模型、智能体),开展靶点识别、结构设计、智能生成、高通量结合虚拟筛选、药效和毒性分析、候选病人筛选、预后预测等创新药物发现研究。并结合动物实验和临床试验,实现干湿试验智能分析决策和融合反馈闭环。研发大规模虚拟药物筛选和全流程自反馈闭环生成式智能体平台,推进药物发现智能化,助力致死率高、罕见性癌症等高挑战的重大疾病国产创新药的研制。目前重点在于设计功能核酸(个性化肿瘤疫苗、小核酸药物、核酸适体)、纳米抗体、抗菌肽、小分子药物等。
3. 多组学多模态智能诊疗
智能化医疗实践的全生命周期,研发医疗智能决策支持算法及平台。利用深度学习、强化学习、NLP、CV、知识图谱等最新人工智能技术,研究多组学多模态数据融合的共性与核心技术,提升多维度数据重建精度,构建病理、影像、临床信息和生物多组学信息(基因、转录、蛋白、代谢、单细胞和空间组学等)的多模态融合分析模型,搭建生命科学基础大模型,全面支持临床智能化,构建智能诊断、多模态多组学、数字病理、药物临床预后、伴随诊断和智能决策等算法及平台。
招收专业
人工智能 (机器学习、深度学习、强化学习、联邦学习、NLP、知识图谱、搜索推荐、CV、Robotics)、计算机科学、软件工程、数据科学、生物信息学、药学、医学、数理统计、电子信息等专业。
招收要求
1)满足博士生报考基本条件,具体要求可点击该链接进一步了解https://mp.weixin.qq.com/s/la9Mm36qR5QmSzUbe_XgBg;
2)热爱科学研究,遵纪守法,品学兼优,身心健康;
3)具备良好的学术背景和研究基础,发表过学术论文;
有意者请将个人简历(含个人联系方式,学习工作经历、研究成果等)发送至jobs@aimlab.cc邮箱,投递统一备注“名字+博士申请”,应聘材料严格保密。 |