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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp 6.4.3 运行出错 LAPACK: Routine ZPOTRF failed! kpoint: 1 spin: 1
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小木虫于

金虫 (正式写手)

[交流] vasp 6.4.3 运行出错 LAPACK: Routine ZPOTRF failed! kpoint: 1 spin: 1

今天编译了vasp6.4.3, epyc 9654 cpu，ubuntu 24.04 server系统。 编译好后，一运行就出现这个错误：
Orbital orthonormalization failed in the inversion of matrix            |
|     LAPACK: Routine ZPOTRF failed! kpoint: 1 spin: 1  

不知道是否有人遇到这个问题，怎么解决的？不吝赐教，非常感谢

信息：结构没有任何问题，用vasp 5.4 运行一切正常，vasp6.4.3就不行
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1楼 2025-11-14 20:36:10
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rlafite

至尊木虫 (正式写手)
★
小木虫于(金币+1): 谢谢参与
Install VASP 6.5.1
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9楼2025-11-15 23:35:25
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小木虫于

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by rlafite at 2025-11-15 23:35:25
Install VASP 6.5.1

是vasp6.4.3有bug么？
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14楼2025-11-16 22:27:27
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小木虫于

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by rlafite at 2025-11-15 23:35:25
Install VASP 6.5.1

试了vasp6.5.0，还是不行，手里没有6,5,1的安装包。时不是用aocc aocl openmpi编译有问题啊
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15楼2025-11-17 08:11:01
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rlafite

至尊木虫 (正式写手)
EPYC 9654 是 Zen4，大部分人遇到这个错误都是因为：

1. 链接到系统自带的 OpenBLAS/BLIS → 数值不稳定

Ubuntu 24.04 默认 LAPACK/OpenBLAS 非常不适合 VASP 6（尤其是大量 BLAS3 操作）。

解决：避免使用系统 OpenBLAS，强烈建议使用 Intel oneMKL。
尤其是 -ffast-math 会让 Hermitian 矩阵出现非正定情况，ZPOTRF 就会炸。

检查你的 makefile.include 是否包含：
-Ofast
-ffast-math
-funsafe-math-optimizations


如果存在，全部改成：

-O2 -march=native
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17楼2025-11-17 12:18:05
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小木虫于

金虫 (正式写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by rlafite at 2025-11-17 12:18:05
EPYC 9654 是 Zen4，大部分人遇到这个错误都是因为：

1. 链接到系统自带的 OpenBLAS/BLIS → 数值不稳定

Ubuntu 24.04 默认 LAPACK/OpenBLAS 非常不适合 VASP 6（尤其是大量 BLAS3 操作）。

解决：避免使用 ...

我是用spack安装的aocc和aocl，vasp的makefile.include 里面是直接连接到了spack安装的。makefile.include如下：
# Default precompiler options
CPP_OPTIONS = -DHOST=\"LinuxGNU\" \
              -DMPI -DMPI_BLOCK=8000 -Duse_collective \
              -DscaLAPACK \
              -DCACHE_SIZE=4000 \
              -Davoidalloc \
              -Dvasp6 \
              -Duse_bse_te \
              -Dtbdyn \
              -Dfock_dblbuf

CPP         = flang -E -ffree-form -C -w $*$(FUFFIX) >$*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS)

FC          = mpif90
FCL         = mpif90

FREE        = -ffree-form -ffree-line-length-none
FFLAGS      = -w -fno-fortran-main -Mbackslash

OFLAG       = -O2
OFLAG_IN    = $(OFLAG)
DEBUG       = -O0

OBJECTS     = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o
OBJECTS_O1 += fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o
OBJECTS_O2 += fft3dlib.o

# For what used to be vasp.5.lib
CPP_LIB     = $(CPP)
FC_LIB      = $(FC)
CC_LIB      = clang
CFLAGS_LIB  = -O
FFLAGS_LIB  = -O1
FREE_LIB    = $(FREE)

OBJECTS_LIB = linpack_double.o

# For the parser library
CXX_PARS    = clang++
LLIBS       = -lstdc++

##
## Customize as of this point! Of course you may change the preceding
## part of this file as well if you like, but it should rarely be
## necessary ...

# relevant target when cross-compiling for another architecture
VASP_TARGET_CPU ?= -march=native
FFLAGS     += $(VASP_TARGET_CPU)

# BLAS (mandatory)
AMDBLIS_ROOT ?= /public/spack/opt/spack/linux-zen4/amdblis-5.0-hi5do7p2j5yk3xxo5eaff76d57ozinlr
BLAS        = -L${AMDBLIS_ROOT}/lib -lblis

# LAPACK (mandatory)
AMDLIBFLAME_ROOT ?= /public/spack/opt/spack/linux-zen4/amdlibflame-5.0-72mkvewha6igrfhobf7uceemuy3xu4dp
LAPACK      = -L${AMDLIBFLAME_ROOT}/lib -lflame

# scaLAPACK (mandatory)
AMDSCALAPACK_ROOT ?= /public/spack/opt/spack/linux-zen4/amdscalapack-5.0-2ok2w3vt4dpnmouvy5ezfksheypcxg3b
SCALAPACK   = -L${AMDSCALAPACK_ROOT}/lib -lscalapack

LLIBS      += $(SCALAPACK) $(LAPACK) $(BLAS)

# FFTW (mandatory)
AMDFFTW_ROOT  ?= /public/spack/opt/spack/linux-zen4/amdfftw-5.0-fuzt5flfdtrmytkknf6dgpcomzpnbpiq
LLIBS      += -L$(AMDFFTW_ROOT)/lib -lfftw3
INCS       += -I$(AMDFFTW_ROOT)/include

# HDF5-support (optional but strongly recommended)
#CPP_OPTIONS+= -DVASP_HDF5
#HDF5_ROOT  ?= /path/to/your/hdf5/installation
#LLIBS      += -L$(HDF5_ROOT)/lib -lhdf5_fortran
#INCS       += -I$(HDF5_ROOT)/include

# For the VASP-2-Wannier90 interface (optional)
CPP_OPTIONS    += -DVASP2WANNIER90
WANNIER90_ROOT ?= /public/spack/opt/spack/linux-zen4/wannier90-3.1.0-qvmhejtugcrv7cz4xenk2y235lld2hrw
LLIBS          += -L$(WANNIER90_ROOT)/lib -lwannier
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18楼2025-11-17 14:39:58
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小木虫于

金虫 (正式写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by rlafite at 2025-11-17 12:18:05
EPYC 9654 是 Zen4，大部分人遇到这个错误都是因为：

1. 链接到系统自带的 OpenBLAS/BLIS → 数值不稳定

Ubuntu 24.04 默认 LAPACK/OpenBLAS 非常不适合 VASP 6（尤其是大量 BLAS3 操作）。

解决：避免使用 ...

非常感谢，已经搞定了，用spack安装的库不行，后来重新单独安装了aocl就可以了。应该是spack安装aocl的时候优化的过头了。
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19楼2025-11-17 15:23:41
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Hewei

金虫 (文坛精英)
★
小木虫于(金币+1): 谢谢参与
帮顶
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21楼2025-11-18 14:28:59
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hs0218

金虫 (正式写手)
★
小木虫于(金币+1): 谢谢参与
用intel oneapi编译
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23楼2025-12-05 15:59:17
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xiaoqiuqiu202楼
2025-11-14 21:44   回复  
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toppaper3楼
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jiaoxg4楼
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miaojiabing7楼
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ckxbear8楼
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