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新虫 (小有名气)

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[交流] 如何通过质谱图判断缺失序列、副产物（如消旋、天冬酰胺酰亚胺形成）并找到解决方案。

1. 缺失序列

这是最常见的合成失败，指在偶联步骤中，某个氨基酸未能连接上，导致肽链缩短。

· 质谱判断：
  · 会在主峰（目标多肽）的质谱图上看到一个或多个系统性提前洗脱的峰。
  · 这些副峰与主峰的质量差对应于一个或多个氨基酸残基的分子量。
  · 示例：目标肽质量 1500 Da。你观察到一个强副峰在 1385 Da。质量差为 115 Da，这正好是天冬氨酸/天冬酰胺的残基质量。这表明在合成序列的某个位置，Asp/Asn 的偶联失败了，导致产生了缺失该氨基酸的肽链。
· 解决方案：
  · 优化偶联：对于缺失位点的氨基酸，在后续合成中采用更高效的缩合剂，如 HATU/HOAt 代替 HBTU/HOBt。
  · 双重偶联：在易失败的位点进行两次连续的偶联反应。
  · 延长反应时间：给予足够的反应时间。
  · 检查氨基酸溶液：确保氨基酸和缩合剂是新鲜、溶解充分的。

---

2. 消旋

发生在氨基酸活化过程中，手性中心α-碳发生外消旋，产生非对映体。

· 质谱判断：
  · 消旋本身不改变分子量，因此无法通过质谱直接判断。
  · 但是，消旋的肽与其对映体在反相HPLC上是可分离的，通常在主峰旁边会出现一个 “双峰” 或 “肩峰”。
  · 间接证据：如果你在HPLC上看到一对非常靠近的峰（保留时间相差很小），并且质谱显示它们具有相同的质荷比，这强烈暗示了消旋的发生。通常发生在 His, Cys, Ser 等易消旋的氨基酸位点。
· 解决方案：
  · 更换缩合剂/添加剂：使用抗消旋能力更强的组合，如 Oxyma Pure/DIC 或 HATU/HOAt。
  · 优化活化条件：避免过度活化，使用低浓度的碱，在较低温度下进行偶联。
  · 使用衍生化氨基酸：对于极易消旋的氨基酸（如Cys, His），使用预形成的衍生物，如 Fmoc-His(Trt)-OH。

---

3. 天冬酰胺酰亚胺形成

这是一个非常常见的副反应，主要发生在 Asn-Gly 序列，其次是 Asp-Gly, Asn-Ser/Thr 等。

· 质谱判断：
  · 天冬酰胺酰亚胺的形成会导致脱水。
  · 在质谱上，你会观察到一个比主峰小 -17 Da 的峰。
  · 示例：目标肽质量 1800 Da。你观察到一个明显的副峰在 1783 Da。这个 -17 Da 的质量差是天冬酰胺酰亚胺形成的典型特征。
· 解决方案：
  · 优化切割条件：使用优化的切割试剂，如试剂 R，其中包含水和苯酚等亲核试剂，可以有效地抑制和打开天冬酰胺酰亚胺。
  · 避免强酸预处理：在合成后、切割前，避免使用TFA/DCM溶液长时间处理树脂。
  · 序列设计：如果可能，在序列设计时避免 Asn-Gly 这样的“高危组合”，或用 Gln 或 Glu 替代。

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1楼2025-10-25 13:50:11

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