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科研战神来了

新虫 (初入文坛)

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[交流] 今日科普：电泳marker为什么跑不开

基本原理核酸电泳是进行核酸研究的重要手段，是分离、鉴定和纯化核酸的主要方法。核酸电泳一般有琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳。琼脂糖凝胶电泳是以琼脂糖作为支持介质的一种电泳方法，常用于DNA切胶回收，DNA分离和用于佐证DNA是否重组、质粒是否切开等等，因其分离范围较广，在实验室中应用广泛。
而marker跑不开的问题，几乎每个科研人都踩过坑。这不仅会直接拖延实验进度，更可能因为无法准确参照分子量，导致后续结果判断失误。接下来，我们就从关键影响因素入手，拆解对应的解决思路

关键影响因素一：琼脂糖浓度

因素：琼脂糖浓度是调控凝胶孔径大小的核心，浓度越高，凝胶内部孔径越小。对于大分子marker片段（尤其是高分子量markers），过小的孔径会形成明显阻碍，导致其迁移速度大幅放缓，最终出现整体跑不动或片段分离效果极差的情况。
解决：需紧扣分子量与浓度的匹配性：小分子量marker（如100-2000 bp）适配1.5%-2%的琼脂糖浓度；中高分子量marker（如1000-10000 bp）建议用0.8%-1.2%；若涉及超大分子量（如＞10000 bp）的marker，浓度可降至0.5%-0.7%，但要注意此时凝胶强度下降，操作时需小心避免断裂。

关键影响因素二：电泳缓冲液

因素：电泳缓冲液的状态直接影响电泳环境稳定性，是marker正常迁移的重要保障。实际实验中，缓冲液反复使用是常见问题，多次使用后，离子浓度会逐渐降低，pH值失衡，直接导致导电性下降，减慢marker迁移速度。此外，缓冲液配制错误也时有发生，比如误将5×或10×母液直接使用，而非稀释成1×工作液，浓度不当同样会干扰迁移。
解决：一是保证缓冲液新鲜，建议现配现用，避免多次重复的使用，TAE或TBE可根据实验习惯选择；二是严格按配方配制，以1×TAE为例，需确保浓度为40mM Tris-乙酸、1mM EDTA，避免浓度偏差引发问题。

关键影响因素三：电压与电泳时间

因素：电压和电泳时间是影响marker迁移效率的两个关键因素，二者配合不当极易导致跑不开。一方面，电压设置过低会使marker迁移速度极慢，即使电泳一段时间，也难看到片段分离；另一方面，即便电压参数合适，若时间不足，marker片段也无法充分散开，呈现聚集状态。

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1楼2025-10-23 11:44:56

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