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新虫 (小有名气)

[交流] 长肽合成(>50aa)的详细方案、疑难解答和案例分享。

以“天然化学连接”为核心的三步法

目前最主流和可靠的方法是 “天然化学连接” 及其衍生技术。

第一步:战略规划与片段设计

这是成功最关键的一步,决定了后续所有工作的难易。

1. 分割位点选择:
   · 首选Cys连接:NCL反应要求一个片段C端为硫酯,另一个片段N端为半胱氨酸。因此,最优策略是在目标序列的天然半胱氨酸位点进行分割。
   · “伪”半胱氨酸策略:若无天然Cys,可通过定点突变,引入一个不影响活性的Cys(如将Ser或Ala突变为Cys)。
   · 多种连接化学:如果无法引入Cys,可以使用其他连接化学,如丝氨酸/苏氨酸连接、KAHA连接等,但NCL因其高效和特异性仍是首选。
2. 片段长度设计:
   · 每个片段长度建议在15-25个氨基酸之间。太短会增加连接步骤;太长则合成和纯化难度指数级增加。
   · 确保每个片段本身合成难度可控,避免在片段内部就包含困难序列。
3. 保护基策略:
   · 片段合成阶段:使用标准的 Fmoc-SPPS。
   · 对于连接位点的氨基酸,侧链保护基必须与连接化学兼容。例如,在NCL中,半胱氨酸的侧链硫醇通常使用对酸稳定的Acm保护基,或在连接时临时保护。

第二步:片段的合成、切割与纯化

1. 片段合成:
   · 采用优化过的Fmoc-SPPS方案,尤其针对可能存在的困难序列(使用我们之前讨论过的 HATU/HOAt, Oxyma/DIC, 假脯氨酸, 骨架酰胺保护基 等策略)。
   · 使用低负载树脂以减少链间聚集。
   · 对于C端为硫酯的片段,需要使用专门的硫酯生成树脂。
2. 片段纯化与鉴定:
   · 这是绝对不能省略的步骤。必须将每个合成出的粗片段通过制备型HPLC进行高纯度纯化(>95%)。
   · 使用分析型HPLC和质谱对每个纯化后的片段进行严格鉴定,确保其序列正确、纯度达标。“垃圾进,垃圾出” 在这里体现得淋漓尽致。

第三步:片段的溶液相连接

1. 连接反应:
   · 将两个纯化的片段在变性条件下(如高浓度胍盐或尿素)混合,以保持片段溶解度。
   · 加入硫醇催化剂(如巯基苯并噻唑),在pH 6.5-7.5的缓冲液中反应。
   · 反应通常在几小时到几十小时内完成,通过HPLC监测反应进程。
2. 后处理与最终纯化:
   · 连接反应完成后,对产物进行脱盐或沉淀。
   · 通过制备型HPLC纯化最终的全长多肽。
   · 使用质谱、分析型HPLC等进行最终鉴定。
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