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无学论hh

新虫 (初入文坛)

[求助] 节杆菌和假节杆菌分离 已有1人参与

有没有大神,能帮忙解答一下我的问题,我的菌在合肥这边测序测16srRNA无双峰显示纯菌,NCBI比对后是节杆菌,然后我就想着测细菌基因组草图找目的基因,把样品送去了生工,但是生工那边一直说有污染,送了三次,每次都显示是节杆菌和假节杆菌这两个属,现在卡在这里进行不下去,有人遇到这种情况吗,或者有解决方法吗?跪谢!
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科研检测交流

金虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

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建议尝试用选择性培养基(如添加特定抗生素或调整碳氮源)或划线分离法多次纯化单菌落,再挑取单菌落重新提取 DNA 测序,大概率能解决节杆菌与假节杆菌的混合污染问题。

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2楼2025-10-20 14:54:31
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无学论hh

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 科研检测交流 at 2025-10-20 14:54:31
建议尝试用选择性培养基(如添加特定抗生素或调整碳氮源)或划线分离法多次纯化单菌落,再挑取单菌落重新提取 DNA 测序,大概率能解决节杆菌与假节杆菌的混合污染问题。

谢谢大佬,我这边已经分离纯化3次了,在合肥这边公司鉴定纯后,送去生工的时候还是不行,选择培养基倒是还没有试过。我今天查文献说假节杆菌属是2016年从节杆菌属中分类出来的,合肥测序发过来的16rs基因序列去NCBi库中比对也会出现几个假节杆菌序列
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3楼2025-10-20 16:59:24
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