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Western Blot实验中蛋白降解的原因与机制
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蛋白降解的生化机制 蛋白酶:无情的"剪刀手" 蛋白酶就像分子世界的"剪刀手爱德华",它们专门切割蛋白质的肽键!我们的细胞内本身就存在大量蛋白酶,它们在细胞破碎后会被释放出来,开始疯狂"剪切"我们宝贵的目标蛋白~ 想象一下,当你把细胞裂解后,就像打开了装满剪刀的抽屉,如果不及时"收走剪刀"(抑制蛋白酶),那么你的目标蛋白就会被剪得七零八落! 不同蛋白酶有不同的"口味": •丝氨酸蛋白酶喜欢切割特定氨基酸位点 •金属蛋白酶需要金属离子协助工作 •半胱氨酸蛋白酶依赖还原环境活化 氧化作用:蛋白质的"锈蚀"过程 氧化作用就像是蛋白质的"生锈"过程。当蛋白质暴露在氧气中时,尤其是含有巯基(-SH)的氨基酸(如半胱氨酸)极易被氧化,形成二硫键,导致蛋白结构改变。 这种氧化会引起: •蛋白质空间构象变化 •聚集形成高分子复合物 •抗原表位变化,影响抗体识别 就像你的铁制品放久了会生锈一样,蛋白质在不当环境中也会"生锈变质"哦~ 导致蛋白降解的关键环节 1️⃣ 样品制备阶段的"致命伤" 样品制备是蛋白降解的高发区!想象一下,当细胞被裂解的那一刻,就像一座城市的围墙被攻破,所有的"坏人"(蛋白酶)都跑出来了! 常见问题: •裂解液中缺少蛋白酶抑制剂 •操作温度过高(室温操作简直是犯罪!) •裂解时间过长,给蛋白酶"充分工作时间" •机械力过大导致热量产生 2️⃣ 储存条件:蛋白的"保鲜"危机 蛋白质样品就像是精致的海鲜,保存不当分分钟变质! 常见错误: •反复冻融(每冻融一次,降解风险+50%!) •储存温度不够低(-20℃对某些蛋白来说根本不够!) •储存容器不合适导致氧化 •保存时间过长 3️⃣ 电泳过程中的隐形杀手 别以为把样品放进凝胶就安全了,电泳过程中的温度升高是蛋白质的另一个"噩梦": •电压设置过高导致温度升高 •电泳时间过长 •缓冲液配制错误改变pH值 4️⃣ 温度波动:蛋白质的"过山车"体验 蛋白质最怕的就是温度的忽高忽低: •从冰箱取出后长时间放置 •实验过程中温度控制不严格 •在不合适温度下进行操作步骤 这就像我们人不能忽冷忽热一样,蛋白质也经不起这种"温度过山车"! 如何判断蛋白是否降解? 怎么知道你的蛋白是否已经"遭遇不测"呢?有这些信号: •条带下方出现smear拖尾(就像蛋白质的"眼泪") •出现预期之外的低分子量条带 •目标条带信号减弱 •内参蛋白也出现异常 毕合生物(www.bihebio.com)提供服务内容:分子生物学、免疫, 重组蛋白及ELISA相关、活性小分子化合物、高端化学、材料化学、细胞资源库与培养相关、生命科学、天然产物 |
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