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科研战神来了

新虫 (初入文坛)

[交流] WB实验常见内参抗体

在蛋白质印迹(Western boltting,WB)实验中,内参抗体是检测内参蛋白的核心工具。不同内参抗体对应不同的内参蛋白,其表达部位、分子量、适用样本类型存在显著差异,选对抗体直接影响WB结果的准确性。今天我们主要针对实验中最常用的几类内参抗体,从核心特性、适用场景到选择注意事项进行全面解析。主要包括β-actin抗体、GAPDH抗体、β-tubulin抗体、Histone H3抗体、ATP1A1抗体、VDAC1抗体等。
01β-actin抗体β-actin是构成细胞骨架的重要蛋白,在几乎所有真核细胞的细胞质中稳定表达亚细胞定位:主要分布于细胞质中。分子量:约42 kDa适用情况:β-actin在 WB 实验中,可用于常规细胞质蛋白检测以校正上样量,适配细胞裂解液、组织匀浆等多种样本,普通实验条件下条带清晰、无需特殊优化。慎用情况:①若目标蛋白位于细胞核(如组蛋白)、细胞膜(如受体蛋白)或线粒体,β-actin的细胞质分布特性使其无法精准校正上样量,易误判结果。②脂肪组织的主要结构成分是大量脂滴,细胞质被挤压得极少,而 β-actin主要分布于细胞质——这种细胞结构特殊性会导致脂肪组织中 β-actin的实际表达量较低且可能不稳定,因此脂肪细胞慎用
02甘油醛-3-磷酸脱氢酶抗体甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)是糖酵解途径的关键酶,在细胞能量代谢中起核心作用,其表达量在多数细胞和组织中稳定。亚细胞定位:主要存在于细胞质中。分子量:约36 kDa适用情况:目标蛋白分子量接近42 kDa时,用β-actin抗体会导致条带重叠,此时选择GAPDH抗体,可清晰区分内参条带与目标蛋白条带;不过也可以直接剥离后孵育,所以这点不是特别的重要;糖代谢相关实验:研究糖酵解、胰岛素信号通路等与能量代谢相关的实验时,GAPDH的表达更能反映细胞 “基础代谢状态”;部分 “β-actin不稳定” 的样本如在脂肪细胞中,β-actin表达可能较低,而GAPDH表达更稳定,此时用 GAPDH抗体作为内参更合适。慎用情况:在细胞缺氧、以及糖尿病模型中一般不用GAPDH。
03β-微管蛋白抗体β-微管蛋白(β-tubulin)是构成细胞微管的主要成分,参与细胞分裂、物质运输等过程,其表达量在多数细胞中稳定亚细胞定位:细胞质分子量:约55 kDa适用情况:用于细胞质蛋白的检测;细胞骨架相关实验:研究微管组装、细胞迁移、细胞极性等与细胞骨架相关的实验时,β-tubulin的表达更贴合实验背景,作为内参更合理;慎用情况:神经细胞中β-tubulin表达较高不适用;非细胞质目标蛋白检测。
04组蛋白H3抗体当检测细胞核内的目标蛋白(如转录因子、组蛋白修饰酶、染色质相关蛋白)时,细胞质内参抗体(β-actin、GAPDH)不再适用 , 因为细胞核提取物中,细胞质蛋白含量极低,内参条带会很弱,无法校正上样量。此时,组蛋白H3抗体是 “细胞核内参的首选”。亚细胞定位:细胞核分子量:约15~17 kDa适用情况:细胞核蛋白提取实验:如提取细胞核提取物,检测 NF-κB、p53 等转录因子的表达时;细胞周期相关实验:研究细胞增殖、分裂(如 G1/S 期转换、有丝分裂)时,组蛋白 H3 的表达稳定,不受细胞周期阶段影响,作为内参更可靠。慎用情况:需要严格区分 “核蛋白样本” 与 “全细胞样本”:在全细胞裂解液中,组蛋白H3的含量远低于β-actin、GAPDH,内参条带会很弱,不适合作为全细胞样本的内参。
05钠钾ATP酶α1亚基抗体钠钾ATP酶α1亚基(ATP1A1)是细胞膜上负责离子转运的关键蛋白,因在细胞膜上稳定表达,常作为 “细胞膜蛋白检测” 的内参抗体亚细胞定位:细胞膜分子量:约110 kDa适用情况:细胞膜蛋白检测实验;膜蛋白提取纯度验证:在提取细胞膜蛋白的实验中,若 ATP1A1 条带清晰,而细胞质内参(如 β-actin)、细胞核内参(如组蛋白 H3)条带微弱,说明膜蛋白提取纯度高,无明显污染。慎用情况:避免用于 “非膜蛋白样本”:在全细胞裂解液中,ATP1A1 的含量远低于细胞质内参,内参条带会较暗;若检测细胞质、细胞核蛋白,不建议用 ATP1A1 抗体作为内参。
06线粒体研究相关抗体①VDAC1是线粒体外膜上的通道蛋白,负责物质进出线粒体,在几乎所有真核细胞的线粒体中稳定表达;分子量约31 kDa适用情况:检测线粒体外膜蛋白[如线粒体融合蛋白1(MFN1)],或验证线粒体提取是否成功(若VDAC1条带清晰,说明线粒体提取有效)。②COX IV是线粒体呼吸链复合物 IV 的亚基,定位于线粒体内膜,参与有氧呼吸,其表达量与细胞呼吸活性无关,在不同细胞和组织中稳定;分子量约17 kDa。
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