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科研战神来了

新虫 (初入文坛)

[交流] WB 实验避坑:那些年我们闯过的祸、犯过的错!

一、Western Blot实验基本原理1、蛋白质分离利用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)技术对蛋白质样品进行分离,使不同分子量的蛋白质在凝胶中按大小排列。该技术基于蛋白质分子在电场中的迁移率差异,实现蛋白质的分离。2、蛋白质转移通过合适的转移方法(如电转移),将分离后的蛋白质从凝胶转移到固相载体(如硝酸纤维素膜(NC 膜)或聚偏氟乙烯膜(PVDF 膜))上。固相载体凭借其独特的物理化学性质,以非共价键形式吸附蛋白质,且能最大程度维持电泳分离后多肽的原有形态以及生物学活性。3、免疫反应将固相载体上的蛋白质作为抗原,与特异性的抗体发生免疫反应。首先加入一抗,它能够精准地识别并结合到目标蛋白上。之后再加入标记有酶或放射性同位素的二抗,二抗与一抗特异性结合。最后,通过底物显色或放射自显影技术,使反应位点产生可见的信号,从而检测出电泳分离后的特异性目的蛋白,实现对特定基因表达蛋白成分的分析。二、新手实验心得    作为一名新手小白,我也独立跑了几次 Western Blot 实验,在这个过程中,大大小小的错误都犯了不少。以下是我遇到的一些问题和经验教训,希望能和大家分享,也欢迎大家补充更多可能走的“冤枉路”。1、配胶问题:下层胶加少了,上层胶不够,插梳子有气泡。解决方案:确保下层胶的量足够,完全覆盖凝胶板底部。在加入上层胶时,注意量的控制,避免不足。插梳子时要缓慢且平稳,避免气泡产生。问题:加完上层胶忘记插梳子。解决方案:在操作过程中,严格按照步骤进行,养成良好的实验习惯,避免遗漏关键步骤。问题:没有泡在电泳液就直接拔梳子,导致凝胶结构破坏。解决方案:在拔梳子前,确保凝胶完全浸没在电泳液中,这样可以防止凝胶结构被破坏,保证后续电泳的顺利进行。
2、上样问题:枪头侧壁蹭了太多液体,导致样品侧壁飘到隔壁孔。解决方案:在上样时,确保枪头垂直插入孔中,避免液体在侧壁积聚。上样动作要轻柔且准确,避免液体溅出。问题:loading buffer加少了,上样很飘。解决方案:确保每个样品中加入足够的loading buffer,通常比例为1:1,这样可以增加样品的密度,使其在电泳过程中更好地沉降。

3、电泳问题:Marker没到底,蛋白还没分开就结束了。解决方案:在电泳开始前,确保Marker完全进入凝胶孔中。根据蛋白质的分子量和电泳条件,合理设置电泳时间和电压,确保蛋白质能够充分分离。
4、转膜问题:配多块胶又一样的时候,有点混淆先后顺序。解决方案:在实验过程中,做好标记和记录,明确每块胶的顺序和对应关系,避免混淆。问题:胶没有泡在电转液里操作,转膜时裂了。解决方案:在转膜前,确保凝胶完全浸没在电转液中,避免凝胶干燥或因操作不当而破裂。问题:夹海绵太厚太紧,膜和胶中空了,中间条带糊了。解决方案:在转膜过程中,确保海绵的厚度和紧实度适中,避免因海绵过厚或过紧导致膜和胶之间产生空隙,影响转膜效果。问题:快速电泳液,400mA转50min,时间太长转过了。解决方案:根据电泳液的类型和转膜条件,合理设置转膜时间和电流强度。对于快速电泳液,建议先进行小规模实验,确定最佳转膜条件。5、封闭问题:快速封闭液过期,封闭不完全,条带黑不溜秋。解决方案:使用新鲜的封闭液,并严格按照说明书进行操作。如果封闭液过期,及时更换新的封闭液,确保封闭效果。

6、裁膜问题:孵多抗体分子量太接近,裁膜极限操作。解决方案:在孵育多个抗体时,尽量选择分子量差异较大的抗体,避免裁膜时的极限操作。如果分子量接近,建议在实验设计阶段进行优化。问题:裁膜没有留上下两个marker。解决方案:在裁膜时,务必保留上下两个marker,以便后续分析时能够准确判断蛋白的分子量。问题:蛋白没有压直,裁膜刚好裁到内参。解决方案:在转膜后,确保蛋白条带平整且位置正确,避免在裁膜时误裁到内参蛋白。7、曝光显影问题:蛋白量大,底物消耗完条带变白。解决方案:在显影前,根据蛋白的含量调整底物的用量,避免底物过早消耗。如果蛋白量较大,可以适当增加底物的量。问题:显影液不均匀覆盖全膜。解决方案:在显影过程中,确保显影液均匀覆盖整个膜,避免局部显影不完全。可以适当摇晃膜,使显影液均匀分布。问题:个别抗体杂带多,目标蛋白不显影。解决方案:选择特异性高的抗体,并优化孵育条件,减少杂带的产生。如果杂带较多,可以考虑更换抗体或调整实验条件。
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