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首尾相搭多肽矩阵（Overlapping Peptide Library): 主要用于全蛋白扫描。蛋白从N端开始，逐步向C端截取设计后，最后很有可能会剩下一条孤肽(Orphan peptide)，我们建议一般是将N端转移一个或者几个氨基酸过来，以保持一致长度。 截头多肽矩阵（Truncation Peptide Library）: 用于确定表位的最小范围。截头多肽矩阵的建立方法一般是系统性地去除原多肽序列两侧氨基酸而得到的。头多肽矩阵用于鉴定与活性有关的最少氨基酸序列。 Ala筛选矩阵(Alanine Peptide Scanning Library): 用于鉴定多肽各位点对生物活性的影响。Ala被系统性地、依次地替代多肽序列中的每一个氨基酸。通过Ala筛选肽库以辨出某一特定氨基酸对整个蛋白结构、功能和其他生物活性的影响。 随机多肽文库（Random Peptide Library）: 此多肽文库的设计是以20种天然氨基酸通过鸟枪式法（shotgun approach）同时地、随机地取代被选择的氨基酸残基。这类文库中的替代肽有可能是增强多肽活性的。 Scrambled Peptide Library: 此类型库的设计是基于原有多肽氨基酸序列的内部置换。它是突变程度最高的多肽文库，被搅乱的多肽通常被用于作为阴性对照证实某一特定序列是蛋白功能或活性的关健。它也是一个用来发现新目标的随机筛选工具。 单位点扫描矩阵(Positional Scanning Peptide Library)： 用于序列改造以提高多肽活性。多肽某个选定的区域或位点被系统地用其他氨基酸替换，这类肽库有助于研究人员发现在某个特定位置上具有特殊影响或活性的特定区域。 |
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