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毕合生物2024

铜虫 (小有名气)

[交流] 外显子、内含子、UTR、CDS、ORF,傻傻分不清?

1️⃣ 外显子:基因的“编码明星”

外显子是基因中能够编码蛋白质的核苷酸序列片段。它们在基因转录后会被保留下来,通过剪接过程拼接在一起,最终形成成熟的mRNA。外显子的序列信息对于蛋白质的合成至关重要,因为它们直接决定了蛋白质的氨基酸序列。外显子的多样性使得基因可以通过不同的剪接方式产生多种不同的蛋白质,这种现象被称为选择性剪接。选择性剪接增加了蛋白质的多样性,使得生物体能够根据不同的生理需求和环境条件产生具有不同功能的蛋白质。

2️⃣ 内含子:基因的“调控助手”

内含子是基因中不参与蛋白质编码的核苷酸序列片段。它们位于外显子之间,在基因转录后会被剪切掉,不会出现在成熟的mRNA中。尽管内含子不直接编码蛋白质,但它们在基因表达调控中起着重要的作用。内含子的序列可以影响基因的转录效率,它们可能包含一些调控元件,如增强子或沉默子,这些元件可以调节基因的转录活性。此外,内含子的剪接过程本身也对基因表达具有调控作用。

3️⃣ UTR:mRNA的“保护盾”

UTR是mRNA分子中的非翻译区,包括5'端非翻译区和3'端非翻译区。5'端非翻译区位于mRNA的起始密码子之前,而3'端非翻译区位于终止密码子之后。虽然UTR不编码蛋白质,但它们在mRNA的稳定性和翻译调控中起着关键作用。5'端非翻译区的序列可以影响mRNA的翻译起始效率,而3'端非翻译区则可以通过与一些miRNA结合,调节mRNA的稳定性和翻译效率。

4️⃣ CDS:编码序列的核心区域

CDS是编码序列的缩写,指的是mRNA分子中能够编码蛋白质的核苷酸序列部分。CDS从mRNA的起始密码子开始,到终止密码子结束。CDS是基因表达的核心区域,因为它直接决定了蛋白质的氨基酸序列。CDS的完整性和准确性对于蛋白质的正常合成至关重要。任何CDS中的突变,如插入、缺失或碱基替换,都可能导致蛋白质的氨基酸序列发生改变,从而影响蛋白质的功能。

5️⃣ ORF:开放阅读框的秘密

ORF是开放阅读框的缩写,指的是mRNA或DNA序列中从一个起始密码子开始到一个终止密码子结束的一段核苷酸序列。ORF是潜在的蛋白质编码区域,因为在这段序列中,遗传密码可以被连续翻译,不会遇到终止密码子。ORF的存在是基因预测和注释的重要依据。通过分析DNA序列中的ORF,可以预测可能的基因位置和编码的蛋白质序列。

6️⃣ 它们之间的关系

外显子、内含子、UTR、CDS和ORF之间存在着密切的关系。外显子是基因中能够编码蛋白质的序列片段,它们在基因转录后被拼接在一起,形成CDS。CDS是mRNA中能够编码蛋白质的核苷酸序列部分,它位于5'端非翻译区和3'端非翻译区之间。ORF是从起始密码子到终止密码子的一段核苷酸序列,它包含了CDS的全部或部分序列。内含子是基因中不编码蛋白质的序列片段,它们在基因转录后被剪切掉,不会出现在成熟的mRNA中。UTR在mRNA的稳定性和翻译调控中起着重要作用,而CDS和ORF则是基因编码蛋白质的核心区域。

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