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[交流] RNA提取大揭秘:方法、优缺点、注意事项全在这啦!

做分子生物学实验,RNA提取可是关键一步!RNA提取的好坏直接影响后续实验的成功与否。今天就来给大家唠唠,RNA提取的常见方法、优缺点,还有超实用的注意事项,赶紧搬好小板凳,认真听讲啦!

RNA提取的常见方法

1️⃣ 酚-氯仿抽提法

这是经典的RNA提取方法。利用酚和氯仿的有机溶剂特性,将细胞或组织中的蛋白质和核酸分离。在碱性条件下,RNA可溶于水相,而蛋白质则进入有机相或沉淀于两相之间。通过反复抽提和离心,可将RNA分离出来。

优点:成本低,能处理多种样本,提取的RNA纯度高,适合RT-PCR和Northern blot等实验。

缺点:酚和氯仿有毒,操作繁琐,耗时长,容易RNA降解。

2️⃣ 柱层析法

利用硅胶膜的特性,在高盐条件下,RNA特异性结合到硅胶膜上,杂质被洗脱掉。通过离心或真空抽滤,可将RNA从硅胶膜上洗脱下来。

优点:操作简便快捷,适合大规模样本处理,提取的RNA纯度高,重复性好。

缺点:成本高,对于含有大量杂质的样本,RNA吸附不完全或杂质残留。

3️⃣ 磁珠法

利用带有特定功能基团的磁性纳米颗粒,这些功能基团可以与RNA特异性结合。通过磁场的作用,可将结合了RNA的磁珠分离出来。

优点:操作简单,自动化程度高,适合高通量样本处理,提取效率高。

缺点:磁珠成本高,性能可能受样本成分干扰,提取低丰度RNA时回收率低。

Trizol法提取RNA的步骤

Trizol法是一种基于酚-氯仿抽提原理的RNA提取方法,因其操作简便、提取效率高且能同时分离RNA、DNA和蛋白质而被广泛应用。

1️⃣ 准备试剂和器材:准备好Trizol试剂以及相应的实验器材,如离心管、移液器、离心机等,并确保所有器材经过RNase-free处理。

2️⃣ 裂解样本:对于组织样本,剪碎后放入离心管中,按照每100mg组织加入1ml Trizol试剂的比例进行裂解;如果是细胞样本,直接将Trizol试剂加入培养皿中,轻轻吹打细胞使其充分裂解。

3️⃣ 分层:裂解完成后,加入氯仿,使裂解液发生分层。经过剧烈震荡后,样本会分为三层:上层是水相(含有RNA),中层是蛋白质层,下层是有机相(主要含有DNA和蛋白质)。

4️⃣ 收集RNA:将上层的水相小心移出至新的离心管中,避免带入中层和下层的杂质。

5️⃣ 沉淀RNA:在水相中加入等体积的异丙醇,使RNA沉淀。经过一段时间的静置后,RNA会以沉淀的形式出现。

6️⃣ 洗涤RNA:用75%的乙醇洗涤RNA沉淀,去除残留的杂质和盐分。洗涤完成后,再次离心,小心移去乙醇。

7️⃣ 溶解RNA:待RNA沉淀晾干后,用适量的RNase-free水或DEPC水溶解RNA,即可得到提取的RNA溶液。

RNA提取的注意事项

1️⃣ 防止RNA酶污染

RNA酶广泛存在于环境中,一旦与RNA接触,就会迅速将其降解。因此,防止RNA酶污染是至关重要的。

使用RNase-free的试剂和耗材:所有用于RNA提取的耗材都必须是RNase-free的。

使用RNase-free的试剂:所有试剂都必须是经过RNase-free处理的。

操作环境清洁:实验操作应在清洁、无尘的环境中进行。

个人防护:实验人员应佩戴一次性手套,避免触摸任何可能接触RNA的器材或试剂。

2️⃣ 样本处理

样本保存:样本在采集后应尽快处理,如果不能立即提取RNA,应保存在低温环境中(如-80℃),避免反复冻融。

样本裂解:确保裂解液充分与样本接触,以保证细胞或组织完全裂解。

避免剧烈操作:避免剧烈震荡或反复冻融,防止RNA断裂。

3️⃣ 提取过程中的注意事项

操作步骤规范:严格按照所选用的RNA提取方法或试剂盒的说明书进行操作。

控制温度:某些步骤对温度有特定要求,应严格按照要求控制操作温度。

去除杂质:尽量去除蛋白质、基因组DNA等杂质,这些杂质可能会影响后续实验的准确性。

避免过度洗涤:在最后的RNA洗涤步骤中,应避免过度洗涤,以免RNA丢失。

4️⃣ RNA质量检测

完整性检测:通过琼脂糖凝胶电泳或毛细管电泳检测RNA的完整性。

纯度检测:通过紫外分光光度计测量RNA的A260/A280比值评估其纯度。

浓度检测:使用紫外分光光度计或荧光定量法测量RNA的浓度。

5️⃣ 后续实验准备

去除残留DNA:如果后续实验对DNA污染较为敏感(如RT-PCR),应在提取RNA后进行DNA去除步骤。

RNA的保存:提取后的RNA应保存在-80℃,并尽量避免反复冻融。如果需要长期保存,可以分装保存,以减少RNA降解的风险。

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