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类器官培养中80%实验室忽略的交叉污染风险
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类器官培养已成为疾病建模、药物筛选的重要工具,但实验室往往聚焦于培养基优化或分化效率,而忽视了一个隐形威胁——交叉污染。据多项研究统计,超过80%的实验室未系统检测类器官的交叉污染,导致实验结果不可重复甚至结论错误(引用见下文)。本文结合文献与实操经验,剖析这一风险的关键来源和解决方案。 一、交叉污染的隐蔽性与高发性 1、细胞系间的污染 类器官常与肿瘤细胞系(如HeLa、HCT-116)共培养,但后者易通过气溶胶或操作污染其他样本。 2、样本间的污染 同一实验室内多患者来源的类器官混用移液器或培养基,可能导致基因型混杂。 3、微生物污染 支原体污染在类器官中难以通过肉眼观察,但会显著改变类器官生长特性。 二、为何实验室容易忽视? 1、表型掩盖:交叉污染的类器官可能仍保持“正常”形态,但基因表达或药敏性已改变。 2、检测成本:STR或SNP分析费用较高,小型实验室倾向于跳过验证。 3、侥幸心理:“从未出事”的心态导致流程松懈。 三、解决方案:低成本高效防控 1、物理隔离 分区操作:将类器官传代、培养基配制、肿瘤细胞培养分至不同超净台。 2、耗材专用:标记不同颜色的移液器用于不同样本。 3、定期检测 STR鉴定:每批次类器官冻存前进行STR分析(参考ATCC标准)。 4、支原体检测:每月用PCR或荧光法筛查(如InvivoGen试剂盒)。 文献推荐流程 参照《Cell Reports Methods》2023年提出的“类器官质量控制清单”,将交叉污染检测纳入必做步骤[4]。 四、总结 交叉污染不是“低概率事件”,而是类器官研究中的“沉默杀手”。通过标准化操作和定期检测,可显著提升数据可靠性。“预防成本远低于重复实验的代价”——这一共识需在实验室内部形成。 |
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