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黎明非语

新虫 (初入文坛)

[交流] topospro软件如何处理2连接节点？

在topospro软件中画拓扑结构，有的配体由于弯曲的构型形成了一个2连接的节点连接两个金属中性，我想问一下这个2连接的节点是否应该保留？据我所知只有三连接以上的才算节点，如果不保留的话该怎样操作，将该节点的折线变成连接两个金属的直线？两个金属之间的距离在9A多
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1楼 2025-05-01 09:34:15
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黎明非语

新虫 (初入文坛)
已经找到解决方法了，选中分子式，点菜单栏中的Compound→Auto determine→Simplity Adjacency Matrix，或者直接Ctrl＋S快捷键跳出弹窗，勾选remove栏中的前三个即：0-coordinated、1-coordinated、2-coordianted，type栏中第一个Valence，点ok即可
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2楼2025-05-01 13:25:19
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