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北科大小学渣

新虫 (正式写手)

[求助] VASP计算石墨烯-Ni(111)界面,结构跑散 已有2人参与

各位虫友好,最近我在用VASP计算石墨烯-Ni(111)界面的结合能和相互作用。我用了4层Ni金属层和单层石墨烯,根据多个文献中的报道,Ni原子排列在C原子上方和六元环中间的上方最稳定,我按这个构建了超晶胞,并设置了20埃的真空层,这种排列Ni(111)晶格失配度在1.2%。结构优化计算中,我固定了石墨烯层中所有的碳原子,并且固定了晶胞参数,只允许所有金属原子自由弛豫。但是弛豫计算结束后,我期待的是所有金属原子应该在x-y面上的位置几乎不变,应该在z轴上弛豫,并且每层金属层上的Ni原子应该还会保持在同一高度(z坐标一样),这样才会和文献中报道的一样,才能得到稳定的界面距离和界面结构。

但是,当结束结构弛豫计算后,结构似乎“跑散”了,即越是远离石墨烯的金属层上的Ni原子不仅会在x-y面上弛豫,并且也会在z方向上弛豫,导致弛豫后Ni原子不在C原子的正上方或六元环的中心的上方,并且z方向上,同一金属层的Ni原子也不再同一高度了,越远离石墨烯的金属层,这种现象更明显。这是为什么?怎么才能得到文献中一样的效果?我的计算问题出在哪儿?

感谢各位提供宝贵的意见。
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chapterr

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 北科大小学渣 at 2025-03-25 16:53:20
感谢你的回答。我是只固定了石墨烯层,允许所有金属层在三个方向上自由弛豫,结果金属层上的Ni就会“跑散”,因为我看到文献中有的文献报道的是固定单层石墨烯和晶胞参数,允许所有金属原子弛豫;还有的文献是使用 ...

我在计算异质结结构的时候也遇到了跟你相似的问题,请问是否有进展?xyz固定某方向的设计是否可行?
6楼2025-04-29 17:21:05
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北科大小学渣

新虫 (正式写手)

INCAR设置:
SYSTEM = try
ISIF = 2
ENCUT = 480
EDIFF = 1E-5
PREC = Accurate
NSW = 500
ISYM = 0
IBRION = 3
POTIM = 0.25
EDIFFG = -0.02
ALGO = Normal
IALGO = 38
ISMEAR = 1
SIGMA = 0.2
NELM = 200
NELMIN = 4
LREAL = Auto
KPAR = 4
NPAR = 10
ISPIN = 2
2楼2025-03-24 23:00:01
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rlafite

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的Ni(111)层在远离石墨烯时“跑散”可能是因为:

Ni 原子自由度过高,应固定底部2层Ni,或在x-y方向约束部分Ni原子。VASP 的 Selective Dynamics 选项可以用于固定某些原子的 x-y 方向,保证其只沿 z 方向弛豫。例如,在 POSCAR 里设置:
Selective dynamics
Direct
x1  y1  z1   F  F  T
x2  y2  z2   F  F  T
...


弛豫参数(IBRION, POTIM, EDIFFG)需要优化,尝试 IBRION = 2、POTIM = 0.1–0.15、EDIFFG = -0.01。

检查K点密度和赝势选择,以确保精度足够。试试 EDIFFG = -0.01 或更严格的值,看看是否能得到更合理的结构。
3楼2025-03-25 00:31:36
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北科大小学渣

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by rlafite at 2025-03-25 00:31:36
你的Ni(111)层在远离石墨烯时“跑散”可能是因为:

Ni 原子自由度过高,应固定底部2层Ni,或在x-y方向约束部分Ni原子。VASP 的 Selective Dynamics 选项可以用于固定某些原子的 x-y 方向,保证其只沿 z 方向弛豫 ...

感谢你的回答。我是只固定了石墨烯层,允许所有金属层在三个方向上自由弛豫,结果金属层上的Ni就会“跑散”,因为我看到文献中有的文献报道的是固定单层石墨烯和晶胞参数,允许所有金属原子弛豫;还有的文献是使用3+3金属层slab,固定远离石墨烯的三层金属层,让靠近石墨烯的三层金属和石墨烯自由弛豫。如果文献中报道的正确的话,这两种方法都不应该使结构“跑散”。你说的固定x, y方向,只允许部分Ni原子在z方向弛豫,会不会导致得不到最稳定的构型?我理解的是即便不固定金属Ni原子,它们也应该大概率只会沿着z方向弛豫,因为我搭建的构型,Ni原子的排列方式应该是最稳定的构型,所有我期待着不需要多少离子步就该结束计算,因为原始结构已经很接近最稳定的构型,只是z方向上的距离需要优化。
4楼2025-03-25 16:53:20
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