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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【讨论】关于Gaussian中输出文件的问题。
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gonemrc

捐助贵宾 (正式写手)

[交流] 【讨论】关于Gaussian中输出文件的问题。

最近发现一个问题，就是：如果用Gaussian的优化计算，
最后优化完毕后，我可以通过查找"stationary point  find" 找到最近的那个Standard orientation作为最后优化的结果;但是如果我中间因为关闭Gaussian，再用geom=check guess=read继续计算时，优化完毕后，可以查找到"stationary point  find"，而那个Standard orientation就找不到了，这时应该怎么选择最终的结果呢？是最近的那个Input orientation么？

希望虫友回答我这个问题：
1>是不是确实存在我描述的这种情况？
2>我的选择对否？

PS：虽然可以通过GV或者是molden来确定我最后要的是哪个，但是我比较关心这原始out文件中的问题。谢谢！！
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1楼 2009-11-03 18:46:20
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shengxiaohong

至尊木虫 (知名作家)

实验员
★ ★ ★ ★
gonemrc(金币+1):谢谢参与
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 11-3 20:36
gonemrc(金币+1,VIP+0): 11-3 20:50
最好不用geom=check guess=read关键字,直接用opt就可以了.
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谌晓洪
2楼2009-11-03 19:36:48
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gonemrc

捐助贵宾 (正式写手)
您的意思是我把中断时最近的坐标输入，继续opt?而不要用geom=check guess=read?
geom=check guess=read是引起没有standard orientation的原因么？谢谢！
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3楼2009-11-03 19:57:45
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
gonemrc(金币+1):谢谢参与
gonemrc(金币+1,VIP+0): 11-3 20:50
这个问题好像没听懂呢?
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4楼2009-11-03 20:35:10
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gonemrc

捐助贵宾 (正式写手)
楼上的兄弟，我的意思是：
开始计算，按照一般的输入后，优化过程中会在out文件中不断产生"standard orientation"表，当stationary point find后，这个"standard orientation"我就把它作为一个优化好后的几何结构;但是在我有几次计算过程中，因为意外停机（如关机等）没有完成优化，我重新启动计算，并没有重新输入坐标，只是从chk文件中用geom=check guess=read来读取坐标，这里的out文件中不会再产生"standard orientation"表了，只有好多的"Input orientation",最后完成计算后，我为了看最后的优化结果，搜索"stationary point find",在附近的"Input orientation"作为最后优化的结果。这样的做法应该可行吧？来版上确定一下。
   另外一个问题就是，我想知道发生这样变化的原因是不是因为我用了geom=check guess=read的结果？

   谢谢！
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5楼2009-11-03 20:50:28
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
只要是最后一步就可以了呀

原因应该就是你描述的
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6楼2009-11-03 22:19:34
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gonemrc

捐助贵宾 (正式写手)
呵呵。只是有点好奇。
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7楼2009-11-03 23:47:15
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zhanggao

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 11-4 16:47
引用回帖:
Originally posted by gonemrc at 2009-11-3 20:50:
楼上的兄弟，我的意思是：
开始计算，按照一般的输入后，优化过程中会在out文件中不断产生"standard orientation"表，当stationary point find后，这个"standard orientation"我就把它作为一 ...

停机的时候我都是取最后一点进行计算。你用的那个关键词我是不会用的。容易出问题。
重新编个。com 文件把先前算的坐标拷进去就行，这样也不容易出错的。

还有就是你的的上次的输入文件关键词有没有改动也是个问题。如果你是给的关键词是nosymm 也是没有standard  orientation
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8楼2009-11-04 15:30:41
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wuy069

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 11-5 16:20
优化好取坐标，最好取最后打印出的坐标，即Test job not archived后面给出的坐标，这个比取标准方位得到的坐标精度更高。
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9楼2009-11-04 22:04:09
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3867826

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 11-5 16:20
我重新启动计算，并没有重新输入坐标
   晕
  你用geom=check guess=read就不用输坐标了！！
输坐标 geom=check guess=read要删掉 要重新算！！
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拒稿，终于体会到了！乱写接受，认真写拒稿，这就是2和4的区别吗？
10楼2009-11-05 09:01:46
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