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gonemrc

捐助贵宾 (正式写手)

[交流] 【讨论】关于Gaussian中输出文件的问题。

最近发现一个问题,就是:如果用Gaussian的优化计算,
最后优化完毕后,我可以通过查找"stationary point  find" 找到最近的那个Standard orientation作为最后优化的结果;但是如果我中间因为关闭Gaussian,再用geom=check guess=read继续计算时,优化完毕后,可以查找到"stationary point  find",而那个Standard orientation就找不到了,这时应该怎么选择最终的结果呢?是最近的那个Input orientation么?

希望虫友回答我这个问题:
1>是不是确实存在我描述的这种情况?
2>我的选择对否?

PS:虽然可以通过GV或者是molden来确定我最后要的是哪个,但是我比较关心这原始out文件中的问题。谢谢!!
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shengxiaohong

至尊木虫 (知名作家)

实验员

★ ★ ★ ★
gonemrc(金币+1):谢谢参与
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 11-3 20:36
gonemrc(金币+1,VIP+0): 11-3 20:50
最好不用geom=check guess=read关键字,直接用opt就可以了.
谌晓洪
2楼2009-11-03 19:36:48
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gonemrc

捐助贵宾 (正式写手)

您的意思是我把中断时最近的坐标输入,继续opt?而不要用geom=check guess=read?
geom=check guess=read是引起没有standard orientation的原因么?谢谢!
3楼2009-11-03 19:57:45
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
gonemrc(金币+1):谢谢参与
gonemrc(金币+1,VIP+0): 11-3 20:50
这个问题好像没听懂呢?
4楼2009-11-03 20:35:10
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gonemrc

捐助贵宾 (正式写手)

楼上的兄弟,我的意思是:
开始计算,按照一般的输入后,优化过程中会在out文件中不断产生"standard orientation"表,当stationary point find后,这个"standard orientation"我就把它作为一个优化好后的几何结构;但是在我有几次计算过程中,因为意外停机(如关机等)没有完成优化,我重新启动计算,并没有重新输入坐标,只是从chk文件中用geom=check guess=read来读取坐标,这里的out文件中不会再产生"standard orientation"表了,只有好多的"Input orientation",最后完成计算后,我为了看最后的优化结果,搜索"stationary point find",在附近的"Input orientation"作为最后优化的结果。这样的做法应该可行吧?来版上确定一下。
   另外一个问题就是,我想知道发生这样变化的原因是不是因为我用了geom=check guess=read的结果?

   谢谢!
5楼2009-11-03 20:50:28
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
只要是最后一步就可以了呀

原因应该就是你描述的
6楼2009-11-03 22:19:34
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gonemrc

捐助贵宾 (正式写手)

呵呵。只是有点好奇。
7楼2009-11-03 23:47:15
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zhanggao

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 11-4 16:47
引用回帖:
Originally posted by gonemrc at 2009-11-3 20:50:
楼上的兄弟,我的意思是:
开始计算,按照一般的输入后,优化过程中会在out文件中不断产生"standard orientation"表,当stationary point find后,这个"standard orientation"我就把它作为一 ...

停机的时候我都是取最后一点进行计算。你用的那个关键词我是不会用的。容易出问题。
重新编个。com 文件把先前算的坐标拷进去就行,这样也不容易出错的。

还有就是你的的上次的输入文件关键词有没有改动也是个问题。如果你是给的关键词是nosymm 也是没有standard  orientation
8楼2009-11-04 15:30:41
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wuy069

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 11-5 16:20
优化好取坐标,最好取最后打印出的坐标,即Test job not archived后面给出的坐标,这个比取标准方位得到的坐标精度更高。
9楼2009-11-04 22:04:09
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3867826

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 11-5 16:20
我重新启动计算,并没有重新输入坐标
   晕
  你用geom=check guess=read就不用输坐标了!!
输坐标 geom=check guess=read要删掉 要重新算!!
拒稿,终于体会到了!乱写接受,认真写拒稿,这就是2和4的区别吗?
10楼2009-11-05 09:01:46
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