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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 微生物基因组比对，拼接，注释软件
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【悬赏金币】回答本帖问题，作者邱霞将赠送您 50 个金币

邱霞

新虫 (小有名气)

[求助] 微生物基因组比对，拼接，注释软件 已有2人参与

有大佬推荐不基于linux系统下的软件做高通量测序基因组分析的软件吗？
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1楼 2025-03-12 12:11:41
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隐约

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
Geneious软件，软件收费，可以试用
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

邱霞
2楼2025-03-12 13:41:18
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
高通量测序如果是二代的，bwa就可以比对，三代的minimap2可以。如果是组装+注释，找一篇类似的文章照着做就行
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

邱霞
···
3楼2025-03-13 09:11:29
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邱霞

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 隐约 at 2025-03-12 13:41:18
Geneious软件，软件收费，可以试用

谢谢
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4楼2025-03-14 09:55:33
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邱霞

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小冀- at 2025-03-13 09:11:29
高通量测序如果是二代的，bwa就可以比对，三代的minimap2可以。如果是组装+注释，找一篇类似的文章照着做就行

谢谢，这两个软件是不是都要在linux系统才能用？
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5楼2025-03-14 09:56:48
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
引用回帖:
5楼: Originally posted by 邱霞 at 2025-03-14 09:56:48
谢谢，这两个软件是不是都要在linux系统才能用？
...

不好意思，我看错了，以为是找linux下的呢
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···
6楼2025-03-14 10:33:39
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cory0931

至尊木虫 (文坛精英)

巫山云
好软件一般都是收费的；
免费好用的大多数都是linux版本；
我们全基因组、全蛋白组分析一般都是送出去找人做的，主要是图个方便
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锤之千古
7楼2025-03-15 08:34:05
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