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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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hbnuwangshuling

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】opt+freq之后能量为什么不是最低?

我在计算并三苯分子时 使用 opt freq关键字没有出现虚频,得到能量是E(RB+HF-LYP) =  -539.546299015,我对优化后的结构稍作了一下调整,竟然能量(E(RB+HF-LYP) =  -539.546359942)比我优化得到的能量还低,这是为什么?优化之后的结构和我做调整之后的结构放到了附件中!
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zxyan

至尊木虫 (文坛精英)

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yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-2 11:14
结构优化就是个反复寻找的过程,最终获得分子的最优结构。
11楼2009-11-02 10:19:25
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hbnuwangshuling

铜虫 (小有名气)

结构

我重新上传了一下结构:
% MEM=2GB
% NPROCLIND=1
% NPROCSHARED=4

# B3LYP/6-31G** nosymm

0opt   

0 1
C              3.660044   -0.713030    0.000015
C              2.479245   -1.406933   -0.000045
C              1.223658   -0.722595   -0.000028
C              1.223660    0.722596   -0.000019
C              2.479248    1.406933    0.000024
C              3.660046    0.713026    0.000058
C              0.000000   -1.403623   -0.000022
C              0.000001    1.403625   -0.000026
C             -1.223658    0.722598   -0.000022
C             -1.223659   -0.722595   -0.000005
C             -2.479246   -1.406933    0.000025
H             -2.476926   -2.493823    0.000064
C             -3.660045   -0.713029    0.000052
C             -3.660045    0.713027    0.000005
C             -2.479247    1.406933   -0.000028
H             -0.000006   -2.491343   -0.000043
H              4.606168   -1.246226    0.000041
H              2.476923   -2.493823   -0.000093
H              2.476928    2.493822    0.000025
H              4.606165    1.246230    0.000113
H             -0.000005    2.491345   -0.000045
H             -4.606166   -1.246230    0.000086
H             -4.606166    1.246228    0.000020
H             -2.476931    2.493823   -0.000071

调整后的结构:

% MEM=2GB
% NPROCLIND=1
% NPROCSHARED=4

# B3LYP/6-31G** nosymm

0opt tiaozheng

0 1
C         3.660096 -0.712985  0.000020
C         2.479166 -1.406940 -0.000050
C         1.223657 -0.722698 -0.000030
C         1.223657  0.722698 -0.000020
C         2.479166  1.406940  0.000020
C         3.660106  0.712985  0.000060
C         0.000000 -1.403568 -0.000020
C         0.000000  1.403578 -0.000030
C        -1.223657  0.722698 -0.000020
C        -1.223657 -0.722698 -0.000010
C        -2.479166 -1.406940  0.000030
H        -2.476989 -2.493834  0.000060
C        -3.660106 -0.712985  0.000050
C        -3.660106  0.712985  0.000010
C        -2.479166  1.406940 -0.000030
H        -0.000010 -2.491284 -0.000040
H         4.606205 -1.246230  0.000040
H         2.476979 -2.493834 -0.000090
H         2.476989  2.493834  0.000030
H         4.606195  1.246230  0.000110
H        -0.000010  2.491294 -0.000050
H        -4.606205 -1.246230  0.000090
H        -4.606205  1.246230  0.000020
H        -2.476989  2.493834 -0.000070
2楼2009-11-01 17:01:35
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mengfc

金虫 (正式写手)

★ ★
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lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 11-1 20:12
初试构型肯定有影响,高斯没有那么智能,你加上OPT+FREQ就找到的一定是基态!其实他找到的是一个稳定结构!
3楼2009-11-01 17:15:47
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 11-1 20:12
很简单:上次找到的是局域最小点
这次找到的……可能是局域最小点也可能是全局最小点
4楼2009-11-01 17:20:07
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