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cjl25413477

木虫 (正式写手)

欧巴

[交流] DNA测学发展到什么程度了!

DNA测序发展到什么程度了,最近又出什么新技术么?
原理是什么?都有什么动植物的全基因组测序完成了,我就知道人类的,小鼠的,酵母的,水稻的,拟南芥的,大熊猫的。小麦的完成了没有啊?
高手进来浏览一下,给出出主意啊!
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路漫漫兮,吾必上下而求索!
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+3,VIP+0):感谢交流 好详细 谢谢 10-31 12:47
引用回帖:
Originally posted by cjl25413477 at 2009-10-31 12:09:
DNA测序发展到什么程度了,最近又出什么新技术么?
原理是什么?都有什么动植物的全基因组测序完成了,我就知道人类的,小鼠的,酵母的,水稻的,拟南芥的,大熊猫的。小麦的完成了没有啊?
高手进来浏览一下,给 ...

现在进行测序的可能有3000多种了吧!主要的测序方法有三种:
454 sequencing
读取长度大,400bp
可以对未知基因组进行从头测序de novo sequencing
当遇到polymer时,如AAAAAA等,荧光强度和碱基个数不成线性关系,判定重复碱基个数有困难

Solexa sequencing
高度自动化的系统
读取片段多,适合进行大量小片段的测序,如microRNA profiling
基于可逆反应,随反应轮数增加,效率降低,信号衰减,读取序列较短,给de novo sequencing 拼接带来困难


SOLiD sequencing
每个碱基读取两次非常高的准确性,特别是对于SNP的检测
灵活的系统,完善的磁珠编码系统,可以进行样品的pooling,分割测序区域
读取长度受连接反应的轮数限制,给de novo sequencing 拼接带来困难
2楼2009-10-31 12:20:34
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cjl25413477

木虫 (正式写手)

欧巴

现在的技术
他的嗵量是多少!一个小时能测多少bp?
路漫漫兮,吾必上下而求索!
3楼2009-10-31 12:28:04
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by cjl25413477 at 2009-10-31 12:28:
现在的技术
他的嗵量是多少!一个小时能测多少bp?

两个星期就可以把你的基因组序列测完了!几万美元就可以搞定了~
4楼2009-10-31 13:48:19
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