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cjl25413477

木虫 (正式写手)

欧巴

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[交流] DNA测学发展到什么程度了！

DNA测序发展到什么程度了，最近又出什么新技术么？
原理是什么？都有什么动植物的全基因组测序完成了，我就知道人类的，小鼠的，酵母的，水稻的，拟南芥的，大熊猫的。小麦的完成了没有啊？
高手进来浏览一下,给出出主意啊！

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路漫漫兮，吾必上下而求索！

1楼 2009-10-31 12:09:43

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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)

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★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
1949stone(金币+3,VIP+0):感谢交流好详细谢谢 10-31 12:47

引用回帖:

Originally posted by cjl25413477 at 2009-10-31 12:09:
DNA测序发展到什么程度了，最近又出什么新技术么？
原理是什么？都有什么动植物的全基因组测序完成了，我就知道人类的，小鼠的，酵母的，水稻的，拟南芥的，大熊猫的。小麦的完成了没有啊？
高手进来浏览一下,给 ...

现在进行测序的可能有3000多种了吧！主要的测序方法有三种：
454 sequencing
读取长度大，400bp
可以对未知基因组进行从头测序de novo sequencing
当遇到polymer时，如AAAAAA等，荧光强度和碱基个数不成线性关系，判定重复碱基个数有困难

Solexa sequencing
高度自动化的系统
读取片段多，适合进行大量小片段的测序，如microRNA profiling
基于可逆反应，随反应轮数增加，效率降低，信号衰减，读取序列较短，给de novo sequencing 拼接带来困难

SOLiD sequencing
每个碱基读取两次非常高的准确性，特别是对于SNP的检测
灵活的系统，完善的磁珠编码系统，可以进行样品的pooling，分割测序区域
读取长度受连接反应的轮数限制，给de novo sequencing 拼接带来困难