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mika金虫 (正式写手)
纳米宝贝
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【求助】请问纳米线模型怎么建啊
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| 可以沿着不同方向的纳米线模型怎么建啊，谢谢了！用MS可以建吗 |
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2楼2009-11-03 16:19:23
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Si纳米管的计算机建模 一、建立新的任务 打开Material Studio软件，出现提示窗口，选择建立新的任务（project），将其命名为si-nanotube。在MS软件的Project栏内出现si-nanotube的Project项目。在这个Project下我们建立一个三维模型。点击新建模型按钮，选择3D Atomistic选项并确定。 打开建模窗口，界面的背景默认为黑色，这里我们可以调为其他的颜色。具体操作：在黑色界面处右击鼠标，选择Display Options，从Background栏内选择自己喜欢的颜色作为背景。这里，我们选择Black-Blue为背景颜色。关闭窗口。 二、单壁Si纳米管模型 在Material Studio建模模块中，有自带纳米管建模板块。Build-Build nanostructure-singlewall nanotube。 这边的N、M为纳米管手性特征参数的n、m数值。这边我们建立单壁扶手椅型（6、6）Si纳米管。Type选择Carbon的C纳米管模型。Bond length为纳米管中的Si-Si键长，根据文献设定为2.245埃。设置完成后Build。在窗口中便出现（6、6）扶手椅型C纳米管。 接下来我们将纳米管中所有的C原子替换曾Si原子。选中所有的原子，步骤：Edit-Select All。 替换原子，步骤：Modify-Modify Element-Periodic Table，选择周期表中的Si，点击OK按钮。 在计算过程中，为了周期性的各个纳米管之间没有相互作用，我们将纳米管的晶胞参数的二维晶格常数增加10埃。 步骤：右击鼠标-Lattice Parameters。将Advanced选项卡中的keep fractional coordinates fixed during changes to the lattice前面的勾去掉。将Parameters选项卡中a和b的数值在原来的基础上增加10埃。关闭窗口。 接下来，调整纳米管的显示方式。右击鼠标，选择Display Style。在Atom选项卡中选择Ball and stick选项并设置显示大小。 另外可以将原子之间的连接键显示出来。步骤：Build-Bonds-Calculate。 这里算出来的键为单双键混合的方式，我们可以将其表示成单键方式。步骤：Edit-Select All。Modify-Modify Bond type-Single Bond。 在计算中，我们用单胞进行计算。但为了描述纳米管的结构，可以将其在一维方向上延长。步骤：Build-Symmetry-supercell。将C值设置周期性延长到数值。 以上讲述的是（6，6）扶手椅型单壁Si纳米管的建模步骤，只要调整纳米管的手性特征参数便可以建立其他手性的单壁Si纳米管模型。 上面建立的纳米管模型的晶胞为斜方结构，为了美观，可以将纳米管放在正方晶格的中央。 首先在纳米管的中央位置加入一个原子。步骤：Build-Add Atoms。例如加入O原子。 重新建立晶胞：Build-Crystal-Rebuild Crystal。在Lattice Parameters选项卡里面将a和b 的数值设为30埃， 角度设置为90°。 将氧原子放置在晶胞的正中央。点击选择O原子。在Properties栏内中找到XYZ条目，记下XYZ的数值。用15减去XY的数值，得到相应的差值。分别为7.98091埃和10.94752埃。 选择模型中所有原子。点击Movement 移动原子。 首先移动X方向，移动的距离为7.9809埃。 再移动Y方向，移动的距离为10.94752埃。 最后去掉O原子，最终建立的模型如下图： 三、双壁Si纳米管模型 建立双壁Si纳米管模型步骤：Build-Build Nanostructures-Multiwall nanotubes。在setup选项卡中将Nanotube definition选择为Individual。点击Individual选项卡。在N、M数值栏中写入所建立的双壁纳米管内外管的手性参数。Build建立纳米管模型。 在这里注意到，所建立的模型软件没有自动建立晶格，我们可以自己建立晶胞。 Build-Crystal-Build Crystal。进入Lattice Parameters选项卡，根据纳米管的直径设置a和b的大小，这里我们设置为30埃，c的大小根据建立的单胞纳米管的长度来设定，其数值为在建立模型窗口中的length的数值。 为了使每个晶胞内含有一个纳米管并且是纳米管位于晶胞的中央，我们建立超晶胞，在二维方向上增加1个胞。步骤：Build-Symmentry-Supercell。 只留下中间的纳米管将其他的纳米管全部去除。选中多余的纳米管-Delete。 四、三壁Si纳米管模型 建立三壁纳米管模型。Build-Nanostructures-Multiwall Nanotubes。 在Setup选项卡中选择Individual。进入Individual选项卡，这里默认的是建立双壁纳米管，我们可以增加纳米管的壁数，点击新增按钮（点击一次增加一个壁）。选择纳米管的手性参数，建立纳米管。 |
3楼2009-11-15 20:47:37
4楼2009-11-15 20:48:07
漂泊四方
金虫 (小有名气)
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qasd(金币+3,VIP+0):xiexie 11-16 21:34
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这个感觉用MS应该是比较容易实现的。 首先，你应该建一个表面模型(slab)，表面所在方向应该是你周期性方向(x). 你需要记下这个方向的单胞参数，方便后面删除掉多余层，在这个方向上实现周期性边界条件。 接着应该建你的纳米线模型(x,y), 根据你的纳米线尺度，删除多余的原子。 里面可能有很多细节地方要注意，比如是否需要H饱和？有没有表面重构啊等等。 之后，你应该在Z方向上注意下，一般切出来的表面模型都不会直接是周期性的，你需要删除多余的层，之后按照新的单胞参数建一下单胞。 |
5楼2009-11-16 09:54:58