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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 指定含水率对应的分子数
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Qing_958

铜虫 (初入文坛)

[求助] 指定含水率对应的分子数

煤分子式：C191H169N3O21S3（分子量2938.63）。将15个煤分子放入一个晶胞后优化，之后对其进行1×1×2超胞，现准备加入水分子以获得1%、3%、5%、7%水含量的含水煤模型，如何计算水分子的个数呢？（论文计算得到的结果总是和我计算的不一致...）
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1楼 2024-12-03 15:56:40
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chauncyjia

新虫 (初入文坛)
纯煤分子构成的体系有密度值可以参考吧，加入的水影响不大的话，先加一些试试，然后跑平衡了看下水的密度质量占比，调整这个比例就可以的。用 MS 跑不动吧，Gromacs 会很快。

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2楼2024-12-03 18:19:17
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Qing_958

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chauncyjia at 2024-12-03 18:19:17
纯煤分子构成的体系有密度值可以参考吧，加入的水影响不大的话，先加一些试试，然后跑平衡了看下水的密度质量占比，调整这个比例就可以的。用 MS 跑不动吧，Gromacs 会很快。
...

主要是想手算一下水分子具体的个数，方便用sorption模块的locate任务
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3楼2024-12-10 14:03:02
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