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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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wastefall

新虫 (初入文坛)

[求助] castep对表面结构优化时出现Incomplete CASTEP output file 错误

【求助】MS的Castep对切出来的表面进行结构优化出现报错,project log里面的提示是
2024/11/29@19:49:38  [39JZ6] - gamma-Fe2O3-optimized (1 1 0) CASTEP GeomOpt ERROR Incomplete CASTEP output file
2024/11/29@19:49:43  [39JZ6] - gamma-Fe2O3-optimized (1 1 0) CASTEP GeomOpt ERROR Error on Job Complete. Failed to import document from C:\Simulation-Liu\gamma-Fe2O3_Files\Documents\Fe2O3(110)\gamma-Fe2O3-optimized (1 1 0) CASTEP GeomOpt\gamma-Fe2O3-optimized (1 1 0).xsd. - Binary file with CASTEP results not present.
2024/11/29@19:49:43  [39JZ6] - gamma-Fe2O3-optimized (1 1 0) CASTEP GeomOpt WARN As instructed, files have been left on remote server, these may need to be manually archived.


castep文件如下所示:
This version was compiled for x86_64-rhel7-intel19.0 on Oct 26 2022
Code version:    fdad7da
Intel(R) Math Kernel Library Version 2019.0.4
Fundamental constants values: CODATA 2018

License checkout of MS_castep successful


Atomic calculation performed for O: 1s2 2s2 2p4

Converged in 61 iterations to an ae energy of -2040.902 eV

Identity difference: 4.10E-04

   ============================================================               
   | Pseudopotential Report - Date of generation 29-11-2024   |               
   ------------------------------------------------------------               
   | Element: O Ionic charge:  6.00 Level of theory: PBE      |               
   | Atomic Solver: Koelling-Harmon                           |               
   |                                                          |               
   |               Reference Electronic Structure             |               
   |         Orbital         Occupation         Energy        |               
   |            2s              2.000           -0.881        |               
   |            2p              4.000           -0.332        |               
   |                                                          |               
   |                 Pseudopotential Definition               |               
   |        Beta     l      e      Rc     scheme   norm       |               
   |          1      0   -0.881   1.100     qc      0         |               
   |          2      0    0.250   1.100     qc      0         |               
   |          3      1   -0.332   1.100     qc      0         |               
   |          4      1    0.250   1.100     qc      0         |               
   |         loc     2    0.000   1.100     pn      0         |               
   |                                                          |               
   | Augmentation charge Rinner = 0.769                       |               
   | Partial core correction Rc = 0.769                       |               
   ------------------------------------------------------------               
   | "2|1.1|14|18|21|20UU:21UU(qc=7)[]"                       |               
   ------------------------------------------------------------               
   |      Author: Chris J. Pickard, Cambridge University      |               
   ============================================================               

Doing a self consistent calculation for the test configuration

Atomic calculation performed for O: 1s2 2s2 2p4

Converged in 61 iterations to an ae energy of -2040.902 eV

---------------------------------------
AE eigenvalue nl 10 =      -18.91475256
AE eigenvalue nl 20 =       -0.88057101
AE eigenvalue nl 21 =       -0.33186952
---------------------------------------
PS eigenvalue nl 20 =       -0.88059206
PS eigenvalue nl 21 =       -0.33182157
---------------------------------------
Maximum eigenvalue error:   4.80E-05

Derived cutoff energies: C=  14 M=  17 F=  20 E=  22

Checking for ghost states up to   1.49452 Ha

No Ghost States Identified

***************************************

Atomic calculation performed for Fe: 1s2 2s2 2p6 3s2 3p6 3d6 4s2

Converged in 96 iterations to an ae energy of -34625.102 eV

Identity difference: 7.18E-04

   ============================================================               
   | Pseudopotential Report - Date of generation 29-11-2024   |               
   ------------------------------------------------------------               
   | Element: Fe Ionic charge:  8.00 Level of theory: PBE     |               
   | Atomic Solver: Koelling-Harmon                           |               
   |                                                          |               
   |               Reference Electronic Structure             |               
   |         Orbital         Occupation         Energy        |               
   |            3d              6.000           -0.276        |               
   |            4s              2.000           -0.194        |               
   |                                                          |               
   |                 Pseudopotential Definition               |               
   |        Beta     l      e      Rc     scheme   norm       |               
   |          1      0   -0.194   2.399     qc      0         |               
   |          2      0    0.250   2.399     qc      0         |               
   |          3      1    0.000   2.399     qc      0         |               
   |          4      1    0.250   2.399     qc      0         |               
   |          5      2   -0.276   1.997     qc      0         |               
   |          6      2    0.250   1.997     qc      0         |               
   |         loc     3    0.000   2.399     pn      0         |               
   |                                                          |               
   | Augmentation charge Rinner = 1.000                       |               
   | Partial core correction Rc = 1.000                       |               
   ------------------------------------------------------------               
   | "3|2.4|2.4|1|9|11|13|40UU:41UU:32U2U2(qc=5.5)[]"         |               
   ------------------------------------------------------------               
   |      Author: Chris J. Pickard, Cambridge University      |               
   ============================================================               

Doing a self consistent calculation for the test configuration

Atomic calculation performed for Fe: 1s2 2s2 2p6 3s2 3p6 3d6 4s2

Converged in 96 iterations to an ae energy of -34625.102 eV

---------------------------------------
AE eigenvalue nl 10 =     -257.20541507
AE eigenvalue nl 20 =      -30.12435919
AE eigenvalue nl 21 =      -25.66770347
AE eigenvalue nl 30 =       -3.45508708
AE eigenvalue nl 31 =       -2.20653500
AE eigenvalue nl 32 =       -0.27580153
AE eigenvalue nl 40 =       -0.19448230
---------------------------------------
PS eigenvalue nl 32 =       -0.27573806
PS eigenvalue nl 40 =       -0.19448391
---------------------------------------
Maximum eigenvalue error:   6.35E-05

Derived cutoff energies: C=   9 M=   9 F=  12 E=  12

Checking for ghost states up to   1.42629 Ha

No Ghost States Identified

***************************************

Pseudo atomic calculation performed for O 2s2 2p4

Converged in 24 iterations to a total energy of -432.6834 eV

Pseudo atomic calculation performed for Fe 3d6 4s2

Converged in 34 iterations to a total energy of -853.8228 eV
i03r3n19
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i03r3n19
i03r3n19

Last known process information:
===============================
Name:        castepexe.exe
State:        R (running)
Tgid:        26924
Ngid:        0
Pid:        26924
PPid:        26921
TracerPid:        0
Uid:        20420        20420        20420        20420
Gid:        73968        73968        73968        73968
FDSize:        0
Groups:        39 10002 73968
Threads:        1
SigQ:        35/1021887
SigPnd:        0000000000000000
ShdPnd:        0000000000000100
SigBlk:        0000000000000000
SigIgn:        0000000000000000
SigCgt:        00000001800046ef
CapInh:        0000000000000000
CapPrm:        0000000000000000
CapEff:        0000000000000000
CapBnd:        0000001fffffffff
CapAmb:        0000000000000000
Seccomp:        0
Speculation_Store_Bypass:        thread vulnerable
Cpus_allowed:        00000000,00000f00
Cpus_allowed_list:        8-11
Mems_allowed:        00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,00000000,000000ff
Mems_allowed_list:        0-7
voluntary_ctxt_switches:        6172
nonvoluntary_ctxt_switches:        7313

请问这个是什么问题,困扰一周了没解决,之前以为可能是中途移动了文件路径,后来重算还是出现这个问题。计算单胞没有这个问题,就在计算表面时出现。设备是本地win10,通过gateway在服务器上计算的。
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