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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】如何在MS里计算单个原子的能量
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gongchangjie

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】如何在MS里计算单个原子的能量

如题 ，急求教，
例如 计算单个氧原子的能量，怎么算？
谢谢达人相助

[ Last edited by gongchangjie on 2009-10-29 at 10:52 ]
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物理改变世界!世界因物理而精彩!
1楼 2009-10-29 10:36:22
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

akashia

银虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+5,VIP+0):谢谢详细指点 10-30 14:48
引用回帖:
Originally posted by gongchangjie at 2009-10-29 10:36:
如题 ，急求教，
例如 计算单个氧原子的能量，怎么算？
谢谢达人相助

[ Last edited by gongchangjie on 2009-10-29 at 10:52 ]

构建并优化O原子
CASTEP 的计算对象只能使周期性结构，因此，为了优化O原子，需要把它放在晶格中。
在Project Explorer 内新建文件夹，选择New | 3D Atomistic Document。右击 3D
Atomistic.xsd，将此文件命名为O.xsd，回车。
一个空的3D 模型文件显示出来。使用Build Crystal 工具创建一个空的晶胞，然后把O原子放进去。
从菜单栏里选择Build | Crystals | Build Crystal。选择Lattice Parameters 标签，把每一晶胞的
长度值a、b 和c 都改为8.00（足以保证原子间相互作用可以忽略），按下Build 按钮。
一个空的晶胞显示在3D 文件中。
选择菜单栏里的Build | Add Atoms。
选择Atoms标签，按下Add 按钮。一个O原子被添加到晶胞的原点，关闭此对话框。
现在需要优化O原子。
从工具条中选择CASTEP 工具，然后选择Calculation。
把Task 中的Energy 改为Geometry Optimization，按下More…按钮，在CASTEP Geometry
Optimization 对话框里，确定未勾选上Optimize Cell项。关闭此对话框。
选择Electronic标签，把k-point 设置由Medium 改为Gamma。
按下Run 按钮。
结束后看Total Energy就行了。

[ Last edited by akashia on 2009-10-30 at 10:55 ]
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悄然回首，已不知春秋。
13楼2009-10-30 10:53:43
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普通回帖

njuswj

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
你可以算下氧分子的，然后除以2
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2楼2009-10-29 11:04:44
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zhangfan2192

金虫 (著名写手)
★
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引用回帖:
Originally posted by njuswj at 2009-10-29 11:04:
你可以算下氧分子的，然后除以2

貌似不是这样的吧

直接画一个氧原子进行计算不就OK了?
赞一下(1人) 回复此楼
相逢是缘！
3楼2009-10-29 13:09:53
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gongchangjie

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by njuswj at 2009-10-29 11:04:
你可以算下氧分子的，然后除以2

氧分子的能量怎么算 ,能详细说么？谢谢
赞一下 回复此楼
物理改变世界!世界因物理而精彩!
4楼2009-10-29 13:10:50
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gongchangjie

金虫 (正式写手)
★
aylayl08(金币+1,VIP+0):谢谢参与 10-29 22:19
引用回帖:
Originally posted by zhangfan2192 at 2009-10-29 13:09:

貌似不是这样的吧

直接画一个氧原子进行计算不就OK了?

MS CASTEP 只计算周期结构。单原子不能算。
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物理改变世界!世界因物理而精彩!
5楼2009-10-29 13:12:25
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想念你的歌27

铁虫 (初入文坛)
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aylayl08(金币+1,VIP+0):谢谢解答 10-29 17:58
建个晶胞 然后将氧原子放到晶胞中 设定好参数你就可以用Castep计算了
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6楼2009-10-29 13:15:57
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gongchangjie

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 想念你的歌27 at 2009-10-29 13:15:
建个晶胞 然后将氧原子放到晶胞中 设定好参数你就可以用Castep计算了

难到不考晶胞的点群？直接选择p1？
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物理改变世界!世界因物理而精彩!
7楼2009-10-29 14:14:17
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想念你的歌27

铁虫 (初入文坛)
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aylayl08(金币+1,VIP+0):谢谢参与 10-29 22:19
引用回帖:
Originally posted by gongchangjie at 2009-10-29 14:14:


难到不考晶胞的点群？直接选择p1？

是的 一般我计算单个分子的能量的时候就这么计算的
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8楼2009-10-29 22:16:21
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guifan

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by njuswj at 2009-10-29 11:04:
你可以算下氧分子的，然后除以2

千万不要这样算，这样算出来的结果肯定是错的，其能量必定小于单个氧原子的能量
因为两个孤立的氧原子形成氧分子，其总能量必定降低
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9楼2009-10-29 23:31:34
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akakcolin

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by guifan at 2009-10-29 03:31:

千万不要这样算，这样算出来的结果肯定是错的，其能量必定小于单个氧原子的能量
因为两个孤立的氧原子形成氧分子，其总能量必定降低

赞同  
建议用LS的方法 建个P1单胞  放个氧原子算
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为人应当诚实正直不能心怀叵测心眼明亮才能迎来幸福避开灾祸盲目者若有人指点才不会迷失道路若单独上路就难以保证不误入岐途
10楼2009-10-29 23:39:12
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