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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求助-菌种鉴定
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shym275

新虫 (初入文坛)

[交流] 求助-菌种鉴定

大家好，我之前在上海生工做了一株霉菌的ITS分析。
我想请教各位怎么根据这些数据确定我的菌种类型呢？
就是下一步该怎么做
谢谢各位
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1楼 2009-10-29 10:06:17
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陈思容

铜虫 (正式写手)
★
shym275(金币+1,VIP+0): 10-29 11:26
同源比对，做进化树
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2楼2009-10-29 10:11:48
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shym275

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by 陈思容 at 2009-10-29 10:11:
同源比对，做进化树

陈同学，能详细些吗？
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3楼2009-10-29 11:30:04
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ahui1883

金虫 (小有名气)
★
shym275(金币+1,VIP+0): 10-29 11:38
去NCBI里进行同源搜索，然后找到模式菌株进行比对。
赞一下 回复此楼
海阔凭鱼跃，天高任鸟飞。
4楼2009-10-29 11:33:59
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爱朝霞

金虫 (小有名气)
去NCBI  进行序列对比
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因知识结识好友，让我们共同进步。
5楼2009-10-29 11:54:58
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陈思容

铜虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
在NCBI 上BLAST以后，会有一系列得分从高到低的同源序列，一般选取得分较高的序列，做进化树，有专门的进化树软件的，找个这方面的高手帮你做一下，或者自己学一下软件的使用，我建议你找个高手做吧，进化树做出来对结果进行分析很关键，我们实验室之前有师姐专门去学了三个月呢
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6楼2009-10-29 15:11:12
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天使鱼安吉

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我可能也要做到真菌的分子鉴定，正在学习
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2009-10-29 17:15:48
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