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【讨论】关于分子对接
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专业: 合成药物化学
[交流]
【讨论】关于分子对接
分子对接没有参考分子怎么办,进行盲接吗?
先利用软件进行空腔探测在做对接,可是如果分子的真正的结合位点不在空腔内而是受体表面怎么办?
再者这样的话计算量是不是太大了。
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1楼
2009-10-28 14:08:00
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专业: 理论和计算化学
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币
+2
,VIP
+0
):
10-28 18:07
1 经验表明,结合位点位于受体表面是很罕见的,一般在进行筛选时即使出现了这种情况,都会人工把它排除掉的
2 可以用LIGSITE之类的侦测一下可能的结合位点,或者找一下同源的蛋白质来比较一下、
[
Last edited by coolrainbow on 2009-10-28 at 17:54
]
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技术博客:http://hi.baidu.com/coolrainbow/blog
2楼
2009-10-28 17:52:25
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