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濒临崩溃的小赵

新虫 (初入文坛)

[求助] 精修后的数据应该如何计算能带和几个优化 已有2人参与

就是我通过GSAS软件精修XRD的数据之后提取出来的cif文件,导入MS中不能计算,报错是cannot have fractional number of electronic and FIX_OCCUPANCY=TRUE。请问一下该如何解决

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濒临崩溃的小赵

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by rlafite at 2024-10-02 00:04:07
可以考虑以下步骤:

检查占据数:确保所有原子的占据数(occupancy)都是完整的整数(如0、1),而不是小数。如果有小数,请将其调整为0或1。

修改CIF文件:

打开CIF文件in VESTA (https://jp-minerals.or ...

您好,我想请问一下,如果同一个位置上,有两种元素,就是概率占据的问题,这种的话可以计算能带结构吗,应该怎样设置MS后去计算

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3楼2024-10-25 08:59:45
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rlafite

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

可以考虑以下步骤:

检查占据数:确保所有原子的占据数(occupancy)都是完整的整数(如0、1),而不是小数。如果有小数,请将其调整为0或1。

修改CIF文件:

打开CIF文件in VESTA (https://jp-minerals.org/vesta/en/download.html),查找所有包含“occupancy”的行。
将小数值(如0.5、0.75等)替换为0或1,确保所有值都是整数。
FIX_OCCUPANCY设置:如果你的模型中确实需要使用小数占据,你可能需要在MS中将FIX_OCCUPANCY设置为FALSE,这可能需要在MS的设置中查找相关选项。

重新导入:在修改完CIF文件后,重新导入到MS中,检查是否仍然出现错误。

检查其他参数:确保CIF文件中的其他参数(如原子坐标、晶格参数等)都符合MS的要求。
2楼2024-10-02 00:04:07
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rlafite

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 濒临崩溃的小赵 at 2024-10-24 12:59:45
您好,我想请问一下,如果同一个位置上,有两种元素,就是概率占据的问题,这种的话可以计算能带结构吗,应该怎样设置MS后去计算
...

如果同一个位置上,有两种元素,就是概率占据的问题,这种的话可以计算能带结构 band structure. We often call it Bloch Spectral Function.
there are two ways to calculate Bloch Spectral Function.
- supercell, for example, you replace 1% of A atom by B atom, first you need to build a 100x unit cell with A atoms, then replace one A atom by B atom. Keep in mind, you need unfoold the banstructure after the calculation, since new supercell is 100x larger than the original unit cell.
- KKR-CPA, coherent-potential-approximation, you can use KKR code, MUST (https://github.com/mstsuite/MuST), AkaiKKR (https://kkr.issp.u-tokyo.ac.jp/download/); juKKR (https://iffgit.fz-juelich.de/kkr/jukkr)
4楼2024-10-26 00:42:51
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上岸117

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

楼主解决了吗,我也是精修后的cif无法几何优化,没有精修的原cif就可以优化
5楼2024-12-05 22:37:55
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