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xianfeng

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】NEB找寻过渡态

各位同仁:
       本人正在学习vasp中NEB计算找寻过渡态,一直不明白其大体的计算过程。那位高手给些指点:计算的步骤如何?有什么需要注意的地方?万分感谢!
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linggang87

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xianfeng(金币+5,VIP+0): 10-28 14:01
qasd(金币+2,VIP+0):谢谢~ 11-2 19:49
首先下载code,script, 按照网站上的说明与VASP结合安装。
计算时事先用VASP优化出初始态和终了态。
用脚本nebmake,按照差值取出一系列中间结构,即IMAGES。
INCAR中设置SPRING=-5,以及IMAGES的数量(必须是核的整数倍)。
等整个计算收敛后,用vfin 以及 nebresult 处理得到势垒曲线。
官方网站:  http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/
上面有关计算设置,以及脚本用法的信息很详细
2楼2009-10-28 08:31:56
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xianfeng

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by linggang87 at 2009-10-28 08:31:
首先下载code,script, 按照网站上的说明与VASP结合安装。
计算时事先用VASP优化出初始态和终了态。
用脚本nebmake,按照差值取出一系列中间结构,即IMAGES。
INCAR中设置SPRING=-5,以及IMAGES的数量(必须是 ...

如果我不利用CI-NEB只利用vasp中的NEB计算,得到的结果如何分析?准确性如何?此外,我发现计算后images之间的距离发生了变化,不再均匀分布,为什么?
3楼2009-11-02 16:49:04
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linggang87

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
xianfeng(金币+3,VIP+0): 11-3 08:57
引用回帖:
Originally posted by xianfeng at 2009-11-2 16:49:




如果我不利用CI-NEB只利用vasp中的NEB计算,得到的结果如何分析?准确性如何?此外,我发现计算后images之间的距离发生了变化,不再均匀分布,为什么?

CI-NEB可能会寻找到更准确的过渡态。下面的网页里可以看到二者的对比。http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/neb/
各INMAGE之间(不包括和端点)的距离一般来说是均匀的,只是鞍点附近可能有偏差,因为鞍点不受spring force的约束。注意INCAR=-5就好了。
4楼2009-11-03 08:08:57
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xianfeng

金虫 (小有名气)

在利用vasp中已有的NEB找寻过渡态时,为什么images之间的距离不一样呢?手册中不是说NEB不改变之间的距离吗?CI-NEB才在鞍点附近改变距离,不受ispring的限制吗?
5楼2009-11-03 09:01:23
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linggang87

银虫 (小有名气)

只用过CI-NEB,鞍点处不受spring force的。
6楼2009-11-04 08:46:52
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xianfeng

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by linggang87 at 2009-11-4 08:46:
只用过CI-NEB,鞍点处不受spring force的。

你好,利用CI-NEB计算找寻过渡态,一般需要多少步循环?上百步?
7楼2009-11-10 10:24:40
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