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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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xiaojie7783

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】建立超晶胞(解决,谢谢大家)

建立超晶胞有什么原则吗?如果想把单胞扩大40倍应该怎么建呢?5×4×2还是5×8×1?

[ Last edited by xiaojie7783 on 2009-11-20 at 09:52 ]
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成功其实很简单,就是当你坚持不住的时候,再坚持一下!
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shenxianshifu

至尊木虫 (知名作家)

宗师


zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q!~ 鼓励讨论! 10-27 21:36
build——symetry——supercell在abc中分别输入要扩大的倍数
2楼2009-10-27 18:34:12
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identation

金虫 (著名写手)

★ ★
zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q!~ 鼓励讨论! 10-27 21:36
xiaojie7783(金币+1,VIP+0):谢谢你 11-4 13:49
引用回帖:
Originally posted by xiaojie7783 at 2009-10-27 11:19:
建立超晶胞有什么原则吗?如果想把单胞扩大40倍应该怎么建呢?5×4×2还是5×8×1?

这个没有特性限制,取决于你要模拟的体系。。。
3楼2009-10-27 18:39:45
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liusanbing

铜虫 (正式写手)

★ ★
aylayl08(金币+1,VIP+0):感谢交流 10-29 18:03
xiaojie7783(金币+1,VIP+0): 11-4 13:58
是没有什么要求,最好建成接近立方,不要建的太长
4楼2009-10-27 19:01:13
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

★ ★
zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q!~ 鼓励讨论! 10-27 21:37
xiaojie7783(金币+1,VIP+0):谢谢你,期待你解答 11-4 13:50
引用回帖:
Originally posted by liusanbing at 2009-10-27 19:01:
是没有什么要求,最好建成接近立方,不要建的太长

也不一定尽量立方,同意3楼说的,具体情况具体分析
比方说,要作扩展一个管的话,主要还是扩展轴向方向,整出来的肯定是细长的
5楼2009-10-27 19:24:39
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guifan

木虫 (著名写手)

★ ★
fegg7502(金币+1,VIP+0):thank you very much! 10-28 04:54
xiaojie7783(金币+1,VIP+0): 11-4 13:52
应该根据具体的体系来,可以参考一下台湾淡江大学李明宪老师的介绍CASTEP的文章,上面提了一些建立超胞的原则
不过扩大40倍的话,原子数肯定不少,到时候的计算量得好好考虑一下,可不要建出来了模型却算不了
6楼2009-10-27 22:47:42
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冬凌草8398

金虫 (正式写手)

博士

★ ★ ★
aylayl08(金币+2,VIP+0):谢谢交流 10-29 18:03
xiaojie7783(金币+1,VIP+0):谢谢你 11-4 13:54
一般超胞也经常见2*2*2或3*2*2,具体情况应结合自己研究的体系。怎么能体现物质的性质较好。正如上楼所说的40倍的胞用分子力学可能还好算,用量子力学就涉及到计算量的问题了。
勇于发现化学世界的美!
7楼2009-10-29 08:49:11
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carlaty

金虫 (正式写手)

aylayl08(金币+0,VIP+0):两天两夜根本不算长,你这个不知多大体系 10-29 18:05
引用回帖:
Originally posted by 冬凌草8398 at 2009-10-29 08:49:
一般超胞也经常见2*2*2或3*2*2,具体情况应结合自己研究的体系。怎么能体现物质的性质较好。正如上楼所说的40倍的胞用分子力学可能还好算,用量子力学就涉及到计算量的问题了。

教训深刻啊,曾经算了2天2夜,job failed
8楼2009-10-29 09:37:29
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mika

金虫 (正式写手)

纳米宝贝


aylayl08(金币+1,VIP+0):谢谢交流 10-29 18:05
对啊,你建的超晶胞太大,浪费时间啊。在保证不相互影响的情况下,应该尽量减小模型
9楼2009-10-29 10:04:47
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xmr0125

木虫 (正式写手)

★ ★
aylayl08(金币+1,VIP+0):谢谢讨论 10-29 18:05
xiaojie7783(金币+1,VIP+0): 11-4 13:57
我算了个小分子,有的时候还优化不好,没有必要算大的,结构都是一样的。怎么和我们实验室的某些人相似。
人生如此!
10楼2009-10-29 15:38:03
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