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TRAINTZ

铜虫 (初入文坛)

[求助] AUTODOCK GPU 使用报错

我在ubuntu上运行autodock gpu对接蛋白质和DNA时提示
Running 1 docking calculation

Kernel source used for development:      ./device/calcenergy.cl                  
Kernel string used for building:         ./host/inc/stringify.h                  
Kernel compilation flags:                 -I ./device -I ./common -DN128WI   -cl-mad-enable
OpenCL device:                           NVIDIA GeForce RTX 4060
Error: System consists of too many atoms.'
       Maximum number of atoms is 256.

Error in parse_liganddata, stopped job.

Error in setup of Job #1
Run time of entire job set (1 file): 0.066 sec
Processing time: 0.000 sec

The job was not successful
但是我缩小了grid box仍然有问题,难道GPU只能处理小分子或者小分子蛋白吗?
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