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AUTODOCK GPU 使用报错
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我在ubuntu上运行autodock gpu对接蛋白质和DNA时提示 Running 1 docking calculation Kernel source used for development: ./device/calcenergy.cl Kernel string used for building: ./host/inc/stringify.h Kernel compilation flags: -I ./device -I ./common -DN128WI -cl-mad-enable OpenCL device: NVIDIA GeForce RTX 4060 Error: System consists of too many atoms.' Maximum number of atoms is 256. Error in parse_liganddata, stopped job. Error in setup of Job #1 Run time of entire job set (1 file): 0.066 sec Processing time: 0.000 sec The job was not successful 但是我缩小了grid box仍然有问题,难道GPU只能处理小分子或者小分子蛋白吗? ![]() ![]() ![]() ![]() |
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