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蛋白质设计
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alphafold3预测蛋白模型,下载后有5个模型,怎么选择呀?第一个模型一定是最好的嘛? 分子对接用DS柔性对接出来的结果和Autodock Vina刚性对接,以及CB-dock2盲对接出来的结合位点都不一样,该怎样取舍呀?需要再用autodouck再试一试柔性对接嘛?或者是diffdock对接?(补充:底物结合位点关键残基未知,仅知道结构域) proteinMPNN用网页版设计后,看结构那里显示error,,总是报错,是因为蛋白质分子太大了嘛?生成的序列怎样评价呀? |
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