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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 请教各位老师，dmol3过渡态
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南何夕q

新虫 (初入文坛)

[交流] 请教各位老师，dmol3过渡态 已有2人参与

请教各位老师，我想问问如果反应是A+B=C+D，怎么绘制反应物分子，是把AB分子放在一起，还是先分别绘制?，然后接下来怎么匹配各个原子，真的十分感谢

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1楼 2024-05-16 00:05:22
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tanglei0810

新虫 (正式写手)
★
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引用回帖:
3楼: Originally posted by 南何夕q at 2024-05-16 11:21:27
十分感谢，我还有个疑问，就是后面反应物与生成物的原子匹配，他不显示有匹配的原子
...

不好意思哈哈，我还是不太理解匹配的原子是什么意思

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4楼2024-05-16 15:13:03
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tanglei0810

新虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
都可以，个人觉得先分别绘制进行结构优化后再放到一起进行结构优化，再进行过渡态搜索更合理。另外，没看明白匹配各个原子是啥意思。

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2楼2024-05-16 00:11:53
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南何夕q

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tanglei0810 at 2024-05-16 00:11:53
都可以，个人觉得先分别绘制进行结构优化后再放到一起进行结构优化，再进行过渡态搜索更合理。另外，没看明白匹配各个原子是啥意思。

十分感谢，我还有个疑问，就是后面反应物与生成物的原子匹配，他不显示有匹配的原子

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3楼2024-05-16 11:21:27
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南何夕q

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by tanglei0810 at 2024-05-16 15:13:03
不好意思哈哈，我还是不太理解匹配的原子是什么意思
...

就是reaction preview里面选择反应物和生成物，里面的原子一一对应
请教各位老师，dmol3过渡态



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5楼2024-05-16 19:26:11
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