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呵护我的梦

新虫 (小有名气)


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pppm静电力算法在NVT系综下,模型整体平移
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各位老师,请教大家,我用MS软件建了一个酰胺类溶液,用pppm静电力算法在NVT系综下运行,轨迹文件中观察到模型中的原子整体平移,而不是平衡振动,导致MSD曲线的数值能达到几十万,扩散系数值非常大。
换成Ewald算法计算,就是原子运动模式正常的,扩散数据也正常,请问有老师知道这是为什么吗?

Ewald计算速度太慢了

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hyjcs2楼
2024-05-10 11:23   回复  
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tzynew3楼
2024-05-10 11:23   回复  
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2024-05-10 11:29   回复  
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dzhaophd5楼
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韩伟6楼
2024-05-10 11:32   回复  
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XG-WUST7楼
2024-05-10 11:36   回复  
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gordon3999楼
2024-05-10 12:46   回复  
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Wally051110楼
2024-05-10 13:01   回复  
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AlexHuihui11楼
2024-05-10 13:02   回复  
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