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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » 关于蛋白质组学的几个问题
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【悬赏金币】回答本帖问题，作者长歌怀采薇2024将赠送您 5 个金币

长歌怀采薇2024

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于蛋白质组学的几个问题

我对于蛋白的研究不算特别深入，但因为工作中会经常接触到蛋白质研究，比如WB，Chip等。
我比较好奇的是，如果我们得到一个未知的蛋白（单一蛋白or 蛋白复合体）如何鉴定该蛋白质复合体是单一的一个蛋白质，还是通过蛋白质-蛋白质相互作用结合在一起的呢？
这个问题也困扰我比较久了。
举个例子。比如组蛋白是H2A，H2B，H3，H4组合在一起，形成1个8聚体（该8聚体我们认为是8个亚基，通过四级结构形成一个完整蛋白质）。那换个思路，那我是不是也可以看作是2个4聚体通过蛋白质相互结合形成8聚体呢？
由此我还是很好奇，如果得到未知结构的蛋白，你可以通过SDS跑出来比如有10个亚基，那你如何判断该蛋白是由10个亚基，通过四级结构形成一个蛋白质。还是例如其中2个亚基，3个亚基，5个亚基各自形成蛋白质后，再通过3个蛋白质蛋白质相互作用结合形成复合体呢？

另外在WB中，设计线性表位，通常是针对某蛋白质中的某个亚基，那么会不会可能因为两个不同的蛋白质中含有2个完全相同的亚基，而在实验中造成假阳性呢？
求各位网友答疑解惑，谢谢。
#蛋白质结构# #蛋白质组学#

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1楼 2024-04-19 01:15:11
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supervincent

新虫 (正式写手)
蛋白组学可能侧重于对大量已知整体变化的判断，比如疾病中不同阶段的变化。对于未知的蛋白可能用组学的方法不合适。

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2楼2024-04-19 07:38:07
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alicelchf

木虫 (著名写手)
组学也有不同大小分子的分析，你说的情况更适合native mass可以分析结构组成
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修身、齐家、治国、平天下
3楼2024-05-31 15:42:13
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夏末～易科

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by supervincent at 2024-04-19 07:38:07
蛋白组学可能侧重于对大量已知整体变化的判断，比如疾病中不同阶段的变化。对于未知的蛋白可能用组学的方法不合适。

动物实验
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4楼2025-05-30 23:15:44
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