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semi-white

铁杆木虫 (著名写手)

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[交流] 【求助】晶体数据库中导出的结构怎么在Gaussian中计算Raman光谱

请教各位大侠,我有3个问题:
1.在高斯中计算一个分子的Raman光谱、直接用opt+freq计算 和先opt优化结构再用freq计算光谱有没有区别?一般用哪个?
2.通常的有机分子,比如酞菁,可以检索到晶体结构数据,可否直接将检索结果用于振动光谱计算(不作能量优化)?
3.接第二个问题,如果可以,导出的晶体结构的cif文件貌似就是一个晶胞,怎样在晶体数据库里面导出分子结构然后导入到高斯?
4.Gaussian计算光谱的时候怎么选方法、基组等参数),以酞菁(C32H18N8)为例?
刚刚转行,望诸位大侠指教~

[ Last edited by semi-white on 2009-10-22 at 16:03 ]
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

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semi-white(金币+20,VIP+0):谢谢~ 虚频是指? 10-22 16:23
lei0736(金币+6,VIP+0):谢谢 10-23 10:34
semi-white(金币+7,VIP+0):都给你吧 1-19 11:04
引用回帖:
Originally posted by semi-white at 2009-10-22 15:53:
1.在高斯中计算一个分子的Raman光谱、直接用opt+freq计算 和先opt优化结构再用freq计算光谱有没有区别?一般用哪个?

没有任何区别,也没有“一般用哪个”。看你个人喜好
引用回帖:
2.通常的有机分子,比如酞菁,可以检索到晶体结构数据,可否直接将检索结果用于振动光谱计算(不作能量优化)?

不能。这样你将得到大量的虚频
引用回帖:
3.接第二个问题,如果可以,导出的晶体结构的cif文件貌似就是一个晶胞,怎样在晶体数据库里面导出分子结构然后导入到高斯?

一个可行的方法:用Mercury软件将其转化成mol 格式。其实可行的方法很多。参看http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1577069这个帖子中的《Mercury2.2最基本的操作》这个教程
引用回帖:
4.Gaussian计算光谱的时候怎么选方法、基组等参数),以酞菁(C32H18N8)为例?

参看http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1577069这个帖子中的《各个方法和基组的组合,分别适合做什么用途》这个教程

最后加一句:欢迎加入高斯计算领域,请阅读《专为Gaussian初学者准备的FAQ(V9.00版)》http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-10-23 at 10:38 ]
2楼2009-10-22 16:07:43
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xuyawen3893

铁杆木虫 (著名写手)


semi-white(金币+1,VIP+0):谢谢参与,这个问大侠~ 10-24 21:21
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2009-10-22 16:07:
没有任何区别,也没有“一般用哪个”。看你个人喜好
不能。这样你将得到大量的虚频
一个可行的方法:用Mercury软件将其转化成mol 格式。其实可行的方法很多。参看[url]http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid ...

请问大侠,高斯可以计算无机晶体吗?
3楼2009-10-24 19:52:14
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★
semi-white(金币+2,VIP+0):谢谢 10-24 21:21
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 10-25 11:50
用PBC应该可以,但对计算机性能要求更高些吧。
4楼2009-10-24 19:56:28
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