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[求助] 求助：请教大家如何将小分子配体和蛋白质放在一个盒子里，保证模拟中小分子配体不丢失

求助，新学gromacs 动力学，在操作中发现模拟后配体找不到，请教大家如何将小分子配体和蛋白质放在一个盒子里，并且保证模拟过程中小分子配体不丢失？大家了解这是哪里出问题了吗？谢谢！！！

海内存知已

1楼 2024-04-12 09:21:01

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新虫 (著名写手)

你这是配体的起始坐标没弄好吧，正常配体起始坐标有调整的话，模拟过程不会丢的

发自小木虫IOS客户端

wzq70402

2楼2024-04-12 12:04:56

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送红花一朵

引用回帖:

2楼: Originally posted by 冰峰 at 2024-04-12 12:04:56
你这是配体的起始坐标没弄好吧，正常配体起始坐标有调整的话，模拟过程不会丢的

谢谢回复，我先查查这个问题。

海内存知已

3楼2024-04-12 14:23:18

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