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lijingl

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】(有奖)请教计算不同缔合数问题

我想考察一下溶液中的氢键缔合情况,看到有的文献中有通过做氢键网络分析来考察溶液缔合情况的。(氢键网络是对溶液结构进行表征的重要手段,包括了分子间氢键的类型以及某种特定构型在缔合中所占的百分含量)
       我知道通过动力学模拟得到的体系坐标,可以根据氢键的几何判别标准来判断是否能形成氢键。这肯定是要根据径向分布函数类似的程序来计算的,但是我没有具体做过这方面的工作,不知道有没有高手指点一下?
       我还想请教一下在氢键网络分析中如何计算不同缔合数的氢键在整个体系中所占的百分数?
       小弟先谢过大家了!

[ Last edited by wuli8 on 2009-11-13 at 22:35 ]
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