| 查看: 672 | 回复: 0 | |||
[交流]
计算生物信息学服务器怎么选
|
|
计算生物信息学 生物信息学利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法研究生物学的问题，生物信息学利用数学工具从大量教据中提取有用的生物学信息，其研究工具是计算机，研究方法包括对生物学数据的搜索(收集和筛选)、处理(编辑、整理、管理和显示)及利用(计算、模拟)，目前主要的研究方向有:序列比对、基因识别、基因重组、蛋白质结构预测、基因表达、蛋白质反应的预测，以及建立进化模型。 生物信息学服务器选型 计算生物信息学服务器分为静音塔式服务器和机架式服务器两种，静音塔式服务器可以放置在办公室像台式机一样使用，机架式服务器可以放置在机房远程使用，用户使用起来非常方便。 目前常用计算生物信息学服务器，分为Intel平台方案和AMD平台方案，基于Intel Xeon CPU平台方案最大支持四路CPU，CPU核心高达112个，最大支持48根内存通道，内存容量高达12TB，基子AMD EPYC CPU平台万案最大支持双路CPU，CPU核心高达256个，线程高达512线程，最大支持32根内存通道，内存容量高8TB、CPU计算能力强劲，内存带宽和容量都非常大，可以加快完成客户的计算生物信息学任务，最大支持4个U.2 SSD固态硬盘，容量高大32TB，每块SSD读写速度高达2000MB/s，读写速度是普通机械硬盘的十几倍，较大提升中间数据的读写速度，从而提升计算速度。最大支持12块3.5英寸机械硬盘，容量高达240TB，方便在本地存储海量的生物信息数据。 机器软件方面，服务器出厂预装Blast，GATK，BWA，Bowtie2等常用或者客户指定的计算生物信息学软件，集成OpenMPI，MPICH并行计算环境，GNU C/C++编译器，GNU Fortran编译器，LAPACK，BLAS,Atas,FFTW等高性能计算函数库，安装CentOs,Ubuntu等多种操作系统，部署机器管理系统和作业调度系统软件删除等管理功能。 ———————————————— 版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。 原文链接：https://blog.csdn.net/HPC_factory/article/details/136835903 |
回复此楼» 猜你喜欢
论文终于录用啦！满足毕业条件了
已经有26人回复
-
2026年机械制造与材料应用国际会议 （ICMMMA 2026）
已经有4人回复
-
磺酰氟产物，毕不了业了！
已经有6人回复
-
求助:我三月中下旬出站，青基依托单位怎么办？
已经有9人回复
-
Cas 72-43-5需要30g，定制合成，能接单的留言
已经有8人回复
-
北京211副教授，35岁，想重新出发，去国外做博后，怎么样？
已经有8人回复
-
自荐读博
已经有3人回复
-
不自信的我
已经有5人回复
-
投稿Elsevier的杂志（返修），总是在选择OA和subscription界面被踢皮球
已经有8人回复
